小豆SSR分子标记遗传连锁图谱构建-论文.pdf

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1、中国农业科学2013,46(17):3534—3544ScientiaAgriculturaSinicadoi:10.3864/j.issn.0578-1752.2013.17.002小豆SSR分子标记遗传连锁图谱构建骆晚侠,张李,杨凯,李奕松,赵波,李明,万平(北京农学院植物科学技术学院/农业应用新技术北京市重点实验室,北京102206)摘要:【目的】以小豆SSR为锚定标记,将公开发表的豇豆SSR、普通菜豆SSR和EST-SSR标记定位整合到小豆遗传连锁群中,构建中国小豆遗传图谱,为小豆基因定位、图位克隆和分子标记辅

2、助选择育种提供更多可用的分子标记。【方法】用1473对SSR和EST-SSR引物进行PCR扩增,包括906对豇豆SSR、123对普通菜豆和196对小豆SSRgI物及248对普通菜豆EST-SSR引物,筛选亲本间多态性标记,验证栽培小豆HB801×AG109及GM892×AG110的F分离群体。【结果】整合和构建了含有145个SSR和EST-SSR标记小豆遗传连锁图谱,包括59个小豆SSR标记,新增63个豇豆SSR、9个普通菜豆SSR、14个普通菜豆EST-SSR标记和1个茎色标记。紫茎色性状被定位在第9连锁群,离CED

3、G022和cbess058标记的遗传距离分别为0.9cM和0.1cM。图谱全长823cM,覆盖11个连锁群,每个标记间平均距离为5.64cM。每个连锁群长度为49.1—125.6cM,平均长度74.82cM;每条染色体上的标记数7—26个,平均13.27个。【结论】率先把小豆近缘物种分子标记弓I入小豆,加密了小豆SSR分子标记遗传连锁图谱。关键词:小豆;SSR;EST—SSR;遗传连锁图谱ConstructionofGeneticLinkageMapUsingSSRMolecularMarkersinAzukiBean

4、(VignaangularisOhwiandOhashi)LUOWan—xia,ZHANGLi,YANGKai,LIYi—song,ZHAOBo,LIMing,WANPing(CollegeofPlantScienceandTechnology,BeijingUniversityofAgriculture/Beo'ingKeyLaboratoryofNewTechnologyinAgriculturalApplication,Bering102206)Abstract:[Objective]ThepublishedSS

5、Rprimersofcowpea,commonbeanandEST-SSR(expressedsequencetags)primersofcommonbeanwerelocatedandintegratedinazukibeanlinkagegrouptoconstructalinkagemapofChineseazukibeanwithazukibeanSSRprimersasanchormarkers.Morepracticalmolecularmarkerswillbesuppliedtogenemapping,

6、cloningandmolecularmarker-assistedselectionofazukibean.[Method]Atotalof1473SSRandEST-SSRprimerpairs,including906SSRprimerpairsofcowpea,123SSRand248EST—SSRofcommonbean,196SSRprimerpairsofazukibean,wereusedforPCRamplificationtoscreenpolymorphicmarkersbetweencultiv

7、atedazukibeanparemsofHB801~AG109andGM892xAG110.TheirF2segregatingpopulationsweretestedwiththepolymorphicmarkers.[Result]Anintegratedgeneticlinkagemapofazukibeancontaining145SSRandEST—SSRmarkerswasconstructed.Thismoleculargeneticlinkagemapiscomposedof59azukibeanS

8、SRanchoringmarkers,newlymapped63cowpeaSSRmarkers,9commonbeanSSRmarkersand14commonbeanEST-SSRmarkers,aswellasastemcolourmarker—thepurplestemtraitwhichislocatedonlinkag

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