中国地方稻种初级核心种质的ssr遗传多样性分析及核心种质的构建

《中国地方稻种初级核心种质的ssr遗传多样性分析及核心种质的构建》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、新疆农业大学硕士学位论文中国地方稻种初级核心种质的SSR遗传多样性分析及核心种质的构建姓名：张冬玲申请学位级别：硕士专业：作物遗传育种指导教师：曲延英;李自超20040501新疆农业大学硕士学位论文2004.5中国地方稻种初级核心种质SSR遗传多样性研究及核心种质构建摘　　　　　要　本文以中国地方稻种初级核心种质3632份材料为研究对象用36对微卫星引物研究了中国地方稻种在丁颖分类体系下的遗传多样性规律以及在地理上的遗传多样性分布并利用形态性状数据和SSR数据对构建核心种质的聚类取样方案进行了探讨研究结果如下36

2、32份地方稻种中共检测出588个等位变异其遗传多样性为0.7431其中在籼稻中检测到的遗传变异数556与在粳稻中检测到的遗传变异数555基本相等但遗传多样性为籼稻0.6918>粳稻0.6086各稻区亚区省内部的籼粳遗传多样性也呈现同样的规律对地方稻种从丁颖分类体系来看其平均遗传多样性为粘糯>水陆>籼粳进一步研究籼粳水陆粘糯的遗传分化显示其分化水平为籼粳>水陆>粘糯说明籼粳之间的差异最大从DNA水平上证明籼粳分化为地方稻种遗传分化的主流籼粳水陆粘糯的遗传多样性和分化都具有位点和染色体的特异性和一

3、致性中国地方稻种在地理上的遗传多样性分布总体上是从南向北呈现降低的趋势从稻区来看华南双季稻区I华中双单季稻区II为中国地方稻种的遗传多样性最大从稻作亚区来看江南丘陵平原双季稻亚区II3闽粤桂平原丘陵双季稻亚区I1滇南河谷盆地单季稻亚区I2琼雷台地平原双击稻多熟亚区I3的多样性大于其余亚区的遗传多样性从行政区划分来看云南为我国地方稻种的遗传多样性中心贵州为籼稻的遗传多样性中心海南为粳稻的遗传多样性中心对核心种质聚类取样方案的研究显示同时用形态性状数据和SSR数据进行聚类压缩的取样方案要优于单独用形态性状数据

4、或SSR数据聚类的取样方案比较不同聚类压缩的预选核心种质综合进行评价后最终确定聚类压缩50为核心种质的最佳取样比例关键词地方稻种　遗传多样性　核心种质　SSR-4-新疆农业大学硕士学位论文2004.5中国地方稻种初级核心种质SSR遗传多样性研究及核心种质构建StudiesonGeneticDiversityofSSRandonSampleStrategyofCoreCollectionofChineseLandraceRice(OryzasativaL.)Zhangdongling(Cropgeneticsan

5、dbreeding)SurpervisedbyProfessorQuyanyingandProfessorLizichaoABSTRACTTheprimarycorecollectionofChineselandracerice(OryzasativaL.)including3632accessionswasstudiedbyusing36microsatelliteprimers.Firstly,thegeneticdiversityanddifferentiationofDingying’staxonomicsy

6、stemwasstudied.Secondly,thedistributionofthegeneticdiversityamongdifferentecologicalzones,differentecologicalsubzones,differentprovinceswasstudied.Thirdly,TheclustermethodwasprobedbyusingthemorphologicaldataandSSRdatafromprimarycorecollectiontocorecollection.Th

7、eresultsisfollowed.ThenumberofallelesandthegeneticdiversityofindicawashigherthanthoseofjaponicaatDNAlevelandthegeneticdiversityandthedifferentiationdistributionwasunevenamongdifferentSSRlociandchromosomes.Itisthesameineachecologicalzone,subzoneandprovince.ForDi

8、ngying’staxonomicsystem,theaveragegeneticdiversityofglutinousriceandnonglutinousricewashigherthanthatofpaddyriceanduplandrice,andthelatterishigherthanthatofindicaandjaponica