中国部分古银杏资源遗传多样性的AFLP 分析及核心种质的构建

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1、园艺学报,2016,43(2):249–260.ActaHorticulturaeSinicadoi:10.16420/j.issn.0513-353x.2015-0601;http://www.ahs.ac.cn249中国部分古银杏资源遗传多样性的AFLP分析及核心种质的构建1,*1,*1,**1112王萱,刘晓静,邢世岩,孔倩倩,张艳辉,孙立民,高燕12(山东农业大学林学院,山东泰安271018;烟台市昆嵛山林场,山东烟台264112)摘要:利用AFLP技术,对来源于全国20个省(区)的180份银杏古树

2、种质进行遗传多样性分析,在此基础上,利用逐步聚类的方法构建核心种质。结果表明,8对AFLP引物组合共扩增出1646条谱带,多态条带百分率(PPB)为100%;平均观测等位基因数(Na)、平均有效等位基因数(Ne)、平均Nei’s基因多样度(H)和平均Shannon’s信息指数(I)分别为2.0000、1.2575、0.1662和0.2746;各种质间的遗传相似系数在0.6904~0.9115之间,平均值为0.7919。建立的银杏古树核心种质保留了原始种质的35%的样品。t检验结果表明,所构建的核心种质遗传多

3、样性指数与原始种质差异不显著,能够最大程度的代表原始种质资源。关键词:银杏;古树;AFLP;遗传多样性;核心种质中图分类号:S664.3文献标志码:A文章编号:0513-353X(2016)02-0249-12AFLPAnalysisofGeneticDiversityandaConstructionoftheCoreCollectionofPartialAncientGinkgoTreesinChina1,*1,*1,**111WANGXuan,LIUXiao-jing,XINGShi-yan,KONGQ

4、ian-qian,ZHANGYan-hui,SUNLi-min,2andGAOYan12(CollegeofForestry,ShandongAgriculturalUniversity,Tai’an,Shandong271018,China;KunyushanForestFarmofYantai,Yantai,Shandong264112,China)Abstract:GinkgobilobaL.,endemictoChina,isoneoftheoldestremainedtreespecies.Stu

5、dieswereinitiatedtoanalyzethegeneticdiversityof180ancientginkgotreesfrom20provincesinChinabasedonamplifiedfragmentlengthpolymorphic(AFLP)marker,andapreliminaryconstructionofthecorecorecollectionwasestablishedbyusingstepwiseUPGMAclusteringsamplingapproach.E

6、ightAFLPprimersselectedwereusedtogenerate1646discernibleDNAbands,100%werepolymorphic.Highgeneticdiversitywasrevealed(numberofdifferentalleles,Na=2.0000;numberofeffectivealleles,Ne=1.2575;Nei’sgenediversity,H=0.1662;Shannon’sinformationindex,I=0.2746).Themo

7、leculargeneticsimilaritycoefficientsrangfrom0.6904to0.9115,withanaverageof0.7919.Thecorecollectionofancientginkgotreeswith63individualsaccountfor35%oforiginalcollection.Theresultsoft-test收稿日期:2015–10–25;修回日期:2016–02–01基金项目:国家科技支撑计划课题(2012BAD21B04);国家植物种质资源

8、共享平台项目(2005DKA21003);山东省农业良种工程重大课题(鲁农良字[2011]7号)*同等贡献者**通信作者Authorforcorrespondence(E-mail:xingsy@sdau.edu.cn)WangXuan,LiuXiao-jing,XingShi-yan,KongQian-qian,ZhangYan-hui,SunLi-min,GaoYan.AFLPanalysisofgeneti

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