118份甘蔗种质资源遗传多样性的aflp分析

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1、作物学报ACTAAGRONOMICASINICA2014,40(10):18771883http://zwxb.chinacrops.org/ISSN0496-3490;CODENTSHPA9E-mail:xbzw@chinajournal.net.cnDOI:10.3724/SP.J.1006.2014.01877118份甘蔗种质资源遗传多样性的AFLP分析*昝逢刚吴才文陈学宽赵培方赵俊刘家勇云南省农业科学院甘蔗研究所/云南省甘蔗遗传改良重点实验室,云南开远661699摘要:采用AFLP标记技术,

2、对来自中国、澳大利亚、美国、菲律宾、巴西和法国的118份甘蔗种质进行遗传多样性分析。采用10对引物组合共扩增出1310条谱带,其中多态性条带为1195条,多态性条带比率为91.2%。118份种质间的相似性系数在0.583~0.929之间,平均为0.750,多态信息量为0.2332,每个位点的有效等位基因数为1.3789。结果显示在相似性系数0.69处切割时,可划分为2个类群,第I类群包括粤糖00-236、云蔗04-622和SP80-1816;第II类群有115份种质,在相似性系数0.74处切割时,可将

3、第II类群划分为5个亚群。各国甘蔗种质亲缘关系较近,其中美国种质遗传多样性相对较丰富。关键词:甘蔗;种质;AFLP;遗传多样性GeneticDiversityof118SugarcaneGermplasmUsingAFLPMarkers*ZANFeng-Gang,WUCai-Wen,CHENXue-Kuan,ZHAOPei-Fang,ZHAOJun,andLIUJia-YongSugarcaneResearchInstitute,YunnanAcademyofAgriculturalSciences/

4、YunnanProvinceKeyLaboratoryofSugarcaneGeneticImprovement,Kaiyuan616699,ChinaAbstract:AFLPmarkerswereusedtoassessthegeneticdiversityof118sugarcanegermplasmfromChina,Australia,USA,Philippines,Brazil,andFrance.Atotalof1310bandswereamplifiedwithtenpairsofpr

5、imers,1195ofwhichwerepolymorphicbands,thepercentageofpolymorphiclociwas91.22%.Thegeneticsimilaritycoefficientamong118sugarcanegermplasmrangedfrom0.583to0.929withanaverageof0.750,thepolymorphisminformationcontentwas0.2332,andtheeffectivenumberofallelespe

6、rlociwas1.3789.Theresultsshowed118germplasmweredividedintotwogroupsat0.69ofthesimilaritycoefficient.ThegroupIconsistedofYT00-236,YZ04-622,andSP80-1816,whichsharedlowergeneticsimilaritywiththerestof115germ-plasminanothergroup.The115germplasmweredividedin

7、tofivesub-groupsat0.74ofthesimilaritycoefficient.Thesugarcanegermplasmsharedhighgeneticsimilarityamongcountries,andthereexistedmuchhighergeneticdiversitywithingermplasmintroducedfromUSA.Keywords:Sugarcane;Germplasm;AFLP;Geneticdiversity甘蔗蔗糖产量约占我国食糖总量的92

8、%,具有遗传环境因素影响而变化,仅依靠表型性状难以准确反映不[3-4]多样性的甘蔗种质资源是甘蔗杂交育种的基础。目前,甘同材料间的遗传差别和亲缘关系。品种系谱虽然在一蔗种质直接用于杂交利用较为普遍,且作用巨大,国外种定程度上能反映品种之间的亲缘关系,但由于自交、串粉[5-7]质资源在我国杂交育种中也具有更重要的作用,我国利等因素,存在一定的局限性,基于分子水平的亲缘关[1][2][8-9]用引进种质Co419、CP49-50、NCo310和CP72-12