华南野生蓖麻遗传多样性分析与核心种质构建

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1、广东海洋大学学位论文原创性声明本人郑重声明：所呈交的论文是本人在导师的指导下独立进行研究所取得的研究成果。除了文中特别加以标注引用的内容外，本论文不包含任何其他个人或集体已经发表或撰写的成果作品。对本文的研究做出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本人完全意识到本声明的法律后果由本人承担。作者签名：弓长舟2010年4月20日学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，同意学校保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅。本

2、人授权广东海洋大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存和汇编本学位论文。本学位论文属于1、保密口，在年解密后适用本授权书。2、不保密团。作者签名：导师签名：(请在以上相应方框内打“4")2010年4月20日华南野生蓖麻遗传多样性研究与核心种质构建摘要本文以258份华南野生蓖麻材料为基础，开展了基于表型标准化数据、SRAP分子标记数据和SSR分子标记数据的遗传多样性研究，初步构建了华南野生蓖麻核心种质。主要结果如下：一、利用13个性状的标准

3、化数据、29对SRAP引物数据和30对SSR引物数据分别对194份、258份、258份华南野生蓖麻材料进行了遗传多样性分析。1、三种聚类结果的平均遗传距离分别为为7．144、9．249和6．519，平均Shannon指数分别为7．486、0．428和0．287，表明SRAP数据能更有效地反应群体的遗传多样性，基因型值数据能更全面地反映群体的变异度。2、SRAP标记检测到的平均等位基因数与SSR标记几乎相等(分别为1．996和2)，但平均有效基因基因数高于SSR标记(分别为1．367和1．182)

4、，表明SRAP标记检测到的等位基因在群体中分布更均匀。SRAP标记的平均Nei’S基因多样性值(0．263)和平均Shannon指数(0．428)高于SSR(0．287和O．153)，SRAP标记比SSR标记更能反映出群体的遗传分化度和遗传变异度。3、三种聚类结果均表明，材料的亲缘关系与地理远近没有直接关系，但小范围内，材料亲缘关系往往较近。同一地区的材料在小组中成组趋势明显。4、广东的材料遗传多样性最丰富，广西次之，海南最低。二、采用混合线性模型，用最小范数二阶无偏估算法(MinimumNor

5、mQuadraticUnbiasedEstimation，MINQUE)估计各项随机效应方差，用调整无偏预测法(AdjustedUnbiasedPrediction，AUP)估算数量性状的基因型值，用UPGMA法聚类后，分别以5％、10％、15％、20％、25％、30％的抽样比例，以最小距离逐步取样法(LDSS)抽样，构建了6个初级核心子集，经代表性评价后从中确定初选核心种质；在此基础上，以6种压缩方式(基因型值、SRAP、SSR、基因型值+SRAP、基因型值+SSR、基因型值+SRAP+SSR

6、)和3种取样策略(最小距离逐步聚类随机取样(LDSRS)、最小距离逐步聚类优先取样(LDSPS)和最小距离逐步聚类偏离度取样(LDSDS))构建备选核心子集，根据对备选核心子集的代表性评价结果建立备选核心种质和核心种质。1、抽样比例为25％的初级核心子集代表性最好，宜作为初选核心种质。2、初选核心种质的平均Shannon(I)指数达到原群体的72．96％，平均Simpson(H)指数达原群体的98．49％，F值和t值均不显著，数量性状的方差、均值和极差的相关系数均高于O．98，数量性状变异系数的

7、相关系数为0．5496，均值差异百分率为0．00，方差差异百分率为100％，极差符合率为94．39％，变异系数变化率为120．59％，对原始群体有较好的代表性。3、对六种压缩方式和三种取样策略的比较分析结果显示，以“基因型值+SRAP+SSR”结合最小距离逐步聚类优先取样法构建核心种质效果最佳。4、根据评价参数及遗传多样性分析结果，初步确定194份华南野生蓖麻的核心种质由以下12份材料组成：HN．HKl0、HN．LV55、HN．LV58、GX21、GX29、GX73、DHD66、ZJ95、LZ2

8、3、LZ36、YJ2、HYl，占原群体的6．19％。5、核心种质的平均Shannon(I)指数为0．648，平均Shannon(I)指数为2．013，F值和t值均不显著，数量性状的方差、均值和极差的相关系数均高于0．99，数量性状变异系数的相关系数为O．8946，均值差异百分率为0．00，方差差异百分率为100％，极差符合率为91．37％，变异系数变化率为120．51％。关键词：华南野生蓖麻，SRAP，SSR，种质资源，遗传多样性，核心种质GeneticDiversityandCoreColle