盐胁迫下红花基因组dna甲基化的msap分析

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1、万方数据每此肇让孝报2011,20(12):116-120垒!竺垒苎兰!兰!!兰竺!里!!竺!!:!!!型竺丝竺兰!!!竺盐胁迫下红花基因组DNA甲基化的MSAP分析李慧1,彭立新1,于玮玮1,冯涛1林木强2,阎国荣1(1.天津农学院园艺系,天津300384;2.天津市静海县良王庄乡政府,天津301601)摘要:以红花幼苗为研究材料,经200mmol·L-1NaCl溶液分别处理4、8、12h,以未经盐胁迫处理为对照(CK),对DNA甲基化变化特征进行MsAP(甲基化敏感扩增多态性)分析。选用13对选扩引物,共检测到3140个基因位点。甲基化水

2、平分析表明,CK,4、8、12h处理样本中总甲基化率分别为31.8%、27.1%、31.0%和31.3%。进一步对不同处理时间红花基因组DNA甲基化模式的变化特征进行分析表明,NaCl处理4h后DNA的去甲基化模式调整占优势,而处理8h及12h后DNA甲基化水平恢复到CK水平,甲基化及去甲基化模式调整基本一致。上述结果显示,盐胁迫条件下红花基因组DNA甲基化状态发生了一定变化,并且这种变化与盐胁迫程度相关,推测DNA甲基化修饰可能参与了红花的盐胁迫应答。关键词:DNA甲基化;MSAP;盐胁迫;红花中图分类号:Q751;$567.2文献标志码:

3、A文章编号:1004—1389(2011)12—0116—05AnalysisofDNACytosineMethylationunderSaltStressinCarthamustinctoriusBasedonMSAPLIHuil,PENGLixinl,YUWeiweil,FENGTa01,LINMuqian92andYANGuoron91(1.DepartmentofHorticulture,TianjinAgriculturalUniversity,Tianjin300384,China:2.GovernmentoftheLiangwa

4、ngzhuangVillage,Tianjin301601,China)Abstract:AnalysisofDNAmethylationstatuswascarriedoutbyMSAP(methylation—sensitiveampli—fledpolymorphism)methodinCarthamustinctoriusL.after200mmol·L1NaClstressfor0,4,8and12h,respectively.Totally,3140geneticlociwereproducedby13pairsofselecti

5、veprimers.TheresultsindicatedthatthecorrespondingtotalDNAmethylationratioswere31.8%,27.1%31.0%and31.3%inthesamplestreatedbyNaClstressfor0,4,8and12h,respectively.FurtheranalysisoftheDNAmethylationpatternssuggestedthatdemethylationadjustmentwaspredominantin4hsamples,however,t

6、hemethylationlevelwasgotbacktothelevelofCKin8and12hsamples,andmethylationadjustmentwasalmostconsistentwithdemethylationadjustment.TheseresultsindicatedthatthechangesofDNAmethylationstatuswerecloselyassociatedwiththeresponsesofsaltstressinCarthamustinctoriusL.Keywords:DNAcyt

7、osinemethylation;MSAP;Saltstress;CarthamustinctoriusL.DNA甲基化(DNAmethylation)是发现最早,也是最主要的表观遗传修饰途径之一,其主要发生在DNA序列中胞嘧啶第5位碳原子上。在高等植物中,DNA甲基化修饰在调控植物生长发育、逆境耐受等方面发挥着重要作用,其调控作用主要是通过对基因表达的调控来实现。一般情况下,DNA发生甲基化与基因的沉默相关,而去甲基化则可导致基因表达。因此,通过探究基因组内DNA甲基化水平与模式的变化,可进一步从表观遗传的角度揭示基因的表达调控特征及机收稿

8、日期:2011—04—15修回日期:2011-06—15基金项目:天津市农业科技成果转化与推广项目(0802210);天津农学院科学研究发展基金计划(200701)

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