简明生物信息学基础实验讲义new

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1、简明生物信息学基础实验讲义王万军叶春郭泰林魏大木生物秀—专心做生物！www.bbioo.com生物秀论坛-专注于生命科学！www.bbioo.com/bbs/西南交通大学生物工程系2004年9月目录第一章计算机应用基础知识1字处理软件——Word2003的使用2Excel基础知识与使用3Foxmail的设置与使用第二章分子生物学软件的使用1序列的格式及其转换——Seqverter1.3的使用2引物设计软件——PrimerPremier4.0的使用3DNA多态性分析软件——DNAsp的使用第三章生物信息学资源挖掘1多序列比

2、对——ClustalX1.8.1的使用4蛋白质结构分析——RasMol2.7.2.1的使用5系统发育树软件——TreeView的使用第四章生物信息学网络资源的应用1生物信息学数据库的使用——GenBank的使用2生物信息学数据库的使用——EMBL的使用第一篇计算机应用基础知识一、字处理软件——Word2003的使用1、软件的基本功能：Word是功能极强的文字处理和版面编排软件，它简单易学，操作界面好、智能化程度高，MicrosoftWord20003作为Word的新版本，保持了以前版本的优点，同时具有更强大的网络功能和通

3、信功能。Word可以编辑各种各样的文档（如报告、文章、演讲稿等）以及对文档各段落的设置；可以打开原先编辑的文档，可以进行新的文档编辑；在进行文档编辑时，可以设置字体，编辑各种格式的文档。2、基本操作：⑴文件的打开、关闭与保存和页面设置。⑵对文字和段落格式的设定。⑶在文档中插入并制作表格。⑷文档编辑中修改。⑴文件的打开、关闭和页面设置：①新建文档：用鼠标点击Word图标，选择图1中“文件”菜单中的“新建”命令即可；图1②打开文档：如图1，打开已存在的文件则选择“文件”菜单中的“打开”，选择要打开文件的存放路径。同时，单击，

4、可以回到目前所处文件夹的上一层文件夹之中。单击，可以打开[工具]下拉式框，使用[查找]、[删除]、[打印]等工具。③保存文档：如图1要保存正在编辑的文件，则选择“文件”菜单中的“保存”，选择该文件的保存路径和该文件的保存格式。在word中使用[保存]指令时，如果文件已经保存过一次，那么单击[保存]指令时，文件就会直接进行保存，而不会出现[另存为]对话框了。当然，也可以把该文件另存为其它文件名或者其它文件格式。如图2所示。图2④页面设置：设定文件版面，在对编辑的文件进行页面设置，如图1所示,选择“文件”菜单中的“页面设置”

5、，出现图3这样的菜单。在这个菜单中就可以进行页边距，单击“确定”,文档将根据所设置出现。图3选择“纸张”，出现如图4的菜单，选择适合纸型，单击“确定”,文档将根据所设置出现。图4⑵文字和段落格式的设定①设定文字字体格式：首先，选定需要设置字体的文字，单击“格式”，出现如图5的菜单。图5然后选择“字体”菜单，出现如图6的菜单。在“字体”标签中选择所需字体、字形、字号，单击“确定”。图6其次设置文字的效果，在图6中，可设置文字的效果，如上下标，字体阴影等。再选中需要设置的文字，然后在图6中选择需要设置文字的效果如选择上标或下

6、标，单击“确定”即可。最后选择字符间距，出现图7菜单，选择间距和位置来设定文字之间的距离，单击“确定”即可。图7②段落格式设定：图8如图8，选择“格式”中的“段落”菜单，出现如下菜单：图9单击“缩进和间距”标签，在“对齐方式”中选择一种段落的对齐方式，单击“确定”。在Word中，除了可以在“段落”对话框中设定段落对齐方式外，还可以在“格式”工具栏中设定段落的对齐方式。在Word的“格式”工具栏中有“两端对齐”、“居中”、“右对齐”及“分散对齐”四项工具按钮，使用这四项工具按钮，就可以改变段落的对齐方式。当然，这里也有其它

7、一些如缩进、间距等对段落的设置。⑶文档中插入表格：把鼠标移到文档中要插入的位置，然后用鼠标选择“表格”菜单，出现如下菜单：图10选择插入表格，出现如下菜单：图11在列数和行数文本框中设定表格的行数和列数，然后单击“确定”，回到Word文档编辑窗口，就会出现设定的表格。⑷文档编辑中修改。在文档的编辑中，需要对编辑过的文章进行修改，当出现这种情况时，可选择菜单栏中的“编辑”进行快速修改，如下图：图12选择“撤消”或“重复”菜单，可进行文章的快速修改。5、作业：用Word编辑一个1500字左右的文档，要求进行字体设置、段落设置

8、和添加表格。二、Excel基础知识与使用1、Excel的基本功能介绍：Excel以二维表格作为基本的操作界面提供给用户，用户通过在表格中输入数据，而由程序自动完成诸如计算、等功能，同时电子表格还具有数据库处理功能。因此，电子表格被广泛应用于统计分析、财务分析、经济、行政等各个领域。2、Excel的基本概念与操作步骤：