资源描述：
《麦田土壤细菌群落16srdnav3片段pcr产物的dgge分析_黄进勇》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、第41卷第4期河南农业大学学报Vo.l41No.42007年8月JournalofHenanAgriculturalUniversityAug.2007文章编号:1000-2340(2007)04-0396-05麦田土壤细菌群落16SrDNAV3片段PCR产物的DGGE分析黄进勇,岳彩鹏,周伟(郑州大学生物工程系,河南郑州450001)摘要:以郑州市郊冬小麦农田土壤为研究对象,利用改进的土壤DNA提取方法提取土壤微生物基因组,并采用降落式PCR和DGGE电泳技术对细菌16SrDNAV3区进行扩增和产物分离,分析了小麦4个生育时期3个土层深度的细菌群落变化.结果表明,麦田土壤细菌多
2、样性极高,小麦整个生育期土壤中一直存在数种优势菌群.但各时期都有新的不同的细菌出现,整体表现为随着小麦的生长多样性逐渐增加,收获期减少.表层土壤各生育时期菌群数量变化较大,而深层土壤菌群数量变化较小.关键词:土壤;冬小麦;细菌群落;DGGE中图分类号:S512.1文献标识码:AAnalysisofBacteriumCommunityinWinter-WheatSoilUsingDGGEof16SrDNAV3FragmentPCRProductsHUANGJin-yong,YUECa-ipeng,ZHOUWei(DepartmentofBio-Engineering,Zhengzh
3、ouUniversity,Zhengzhou450001,China)Abstract:UsingimprovedextractionmethodofsoilDNAandsoilfromthewinterwheatfieldsinZhengzhousuburbasexperimentsubjec,tweextratedtheDNAgenomefromsoilmicrobials.Inthispaper,thediversityofbacterialcommunitywasstudiedbyamplifyingthebacterial16SrDNAV3frag-mentwithto
4、uch-downPCRmethod,andseparatingtheproductsbydenaturinggradientgelelectropho-resis(DGGE).Soilsamplesweretakenatthreedifferentdepthsatfourdifferentstages.Theresultshowedtha,tthediversityofsoilbacteriaishigherinwheatfields.Withthegrowthofwhea,tthed-iversityisincreasinggradually,anddecreasinginha
5、rvestperiod.Thereareafewstableanddominantbacteriacommunitiyinthewholewheatgrowthperiod,butsomenewdifferentbacteriaappeareateveryperiod.Thenumberofbacteriacommunitiyintopsoilchangesmoregreatlythanindeepsoilindiffer-entperiod.Keywords:soi;lwinterwhea;tbacteriumcommunities;denaturinggradientgele
6、lectrophoresis(DGGE)[1]冬小麦-夏玉米种植模式是中国北方地区广映微生物的实际存在状态.近年来发展起来的泛采用的集约化种植方式,通过对该模式下土壤细变性梯度凝胶电泳(Denaturinggradientgelelectro-菌群落多样性的变化研究,将为该地区农业生产模phoresis,DGGE)技术则是基于16SrDNA保守性的式的改进提供理论支持.传统的微生物多样性研究DNA指纹技术,在不需要纯培养的条件下能够对[2]以纯培养技术为主,但实验室能够分离培养出的微微生物的复杂群落进行有效分析.作者采用生物只占其中的0.01%~10.0%,不能很好的反PCR-D
7、GGE技术对小麦不同生育期及不同土层深收稿日期:2007-03-20基金项目:河南省自然科学基金项目(0511030400)作者简介:黄进勇(1969-),男,河南周口人,副教授,博士,从事农业环境生物学研究.第4期黄进勇等:麦田土壤细菌群落16SrDNAV3片段PCR产物的DGGE分析397-1度的细菌多样性进行了研究,以期为调控农业生产TaqDNA聚合酶(5U#LL).扩增条件采用梯度方式和进行合理的生产管理提供科学依据.PCR策略:94e预变性5min;前24个循环为94e
