饲喂蚕豆的草鱼肠道细菌群落的pcr_dgge分析

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1、第44卷第5期淡水渔业2014年9月Vol.44No.5FreshwaterFisheriesSep.2014饲喂蚕豆的草鱼肠道细菌群落的PCR-DGGE分析1,21,231,21,231,2吴康,胡俊,黄晓声,夏虎,陈亮,李男,张学振(1.华中农业大学水产学院,武汉430070;2.淡水水产健康养殖湖北省协同创新中心,武汉430070;3.中山市水产技术推广中心站,广东中山528403)摘要:为探讨饲喂蚕豆(Viciafaba)对草鱼(Ctenopharyngodonidellus)肠道菌群的影响,采用PCR-DG

2、GE技术比较了饲喂蚕豆的草鱼(脆肉鲩组)及饲喂配合饲料的草鱼(普通草鱼组)肠道微生物菌群的异同。结果显示,DGGE图谱上出现了20条明显条带,表明脆肉鲩组及普通草鱼组肠道中均存在大量细菌群落。对这20条条带测序后,获得了其中17条条带的序列,这17条条带中有9条是尚未被培养的细菌。经分析发现,这17条条带分属于变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)及未分类的细菌,其中变形菌门为两组肠道的优势菌。实验还

3、发现,饲喂蚕豆对肠内容物菌群的影响大于对肠壁菌群的影响。结果表明,饲喂蚕豆不改变草鱼肠道菌群的种类,但对肠道菌群的相对丰度有一定影响。关键词:草鱼(Ctenopharyngodonidellus);蚕豆(Viciafaba);脆肉鲩(CtenopharyngodonidellusC.etV);肠道菌群;DGGE中图分类号:S917.4文献标识码:A文章编号:1000-6907-(2014)05-0021-06DOI:10.13721/j.cnki.dsyy.2014.05.004PCR-DGGEanalysisofi

4、ntestinalmicroecologyofCtenopharyngodonidellusfedwithViciafaba1,21,231,21,2WUKang,HUJun,HUANGXiao-sheng,XIAHu,CHENLiang,31,2LINan,ZHANGXue-zhen(1.FisheriseCollege,HuazhongAgriculturalUniversity,Wuhan430070,China;2.FreshwaterAquacultureCollaborativeInnovationCen

5、terofHubeiProvince,Wuhan430070,China;3.FisheriesTechnicalExtensionCenterofZhongshanCity,Zhongshan528403,Guangdong,China)Abstract:Toevaluatetheeffectoffababeanonintestinalflora,theintestinalmicrobiotaofcrispgrasscarpgroup(grasscarpfedwithfababean)andgrasscarpgro

6、up(grasscarpfedwithformulafeed)wereinvestigatedusing16SrDNAPCRdenaturinggradientgelelectrophoresis(PCR-DGGE)technology.TwentyDGGEbandsappearinginDGGEfingerprintre-vealedthattherewerenumerousintestinalmicrobiotainthetwogroups.SeventeenDGGEbandsweresuccessfullyse

7、-quenced.However,nineofthesebandswereclassifiedasunculturableaccordingtothephylogeneticanalysis.Thedomi-nantbacteriainthefore-gutandmid-gutofthetwogroupsallbelongedtoProteobacteria,andotherbacteriaidentifiedbe-longedtoactinobacteria,firmicutes,bacteroidetesandu

8、nclassified-bacteria.Theresultalsoshowedthattheinfluencecausedbyfababeanonintestinalmicrobiotawasmoreremarkableinintestinalcontentthaninintestinalwall.Theseresultssuggestedt

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