PLFA法和DGGE法分析堆肥细菌群落变化.pdf

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1、农业环境科学学报2011,30(6)：1242—1247JournalofAgro—EnvironmentSciencePLFA法和DGGE法分析堆肥细菌群落变化喻曼1，肖华1，张棋1，曲云欢2，许育新p(1．浙江省农业科学院环境资源与土壤肥料研究所，杭州310021；2．环境保护部环境保护对外合作中心，北京100035)摘要：同时采用PLFA(Phospholipidfatryacid)谱图分析法和DGGE(Denaturinggradientgelelectrophoresis)法分析农业废物堆肥化过程中细菌群落的变化。结果表明：(1)单体PLFA数据显示样品之间的群落结构有明显差异，随

2、着堆肥进程的进行，群落在不断演替，PLFA数据可以较为明确地表征微生物生物量的变化，但不能给出具体的物种变化信息；(2)DGGE分析显示堆肥过程中的样点和DGGE条带数据都存在3大主要类别，堆肥过程中细菌群落结构至少经历了3个阶段的演替，即嗜温细菌群落、高温细菌群落和腐熟期细菌群落。堆肥过程是微生物群落结构与堆肥温度相互制约韵过程；(3)虽然两类方法显示的信息并不完全一致，但也因此说明了不同方法显示的信息并不是绝对的，采用各类方法组合研究堆肥微生物的信息变化是很有必要的。关键词：PLFA法；DGGE法；堆肥；细菌群落中图分类号：$141．4文献标志码：A文章编号：1672—2043(2011

3、)06—1242--06ChangesofBacterialCommunitiesinCompostingbyPLFAandDGGEMethodsYUManl，XIAOHual，ZHANGQi1，QUYun-huan2,XUYu-xinl‘(1．EnvironmentalResourcesandSoilFertilizerInstitute，ZhejiangAcademyofAgriculturalSciences，Hangzhou310021，China；2．ForeignEconomicCooperationOffice，MinistryofEnvironmentalProtection

4、，Beijing100035，China)Abstract：Microbialcommunitystructureislittleknownatdifferentstagesduringthecompostingproce蹋duetodifficulttoculturemicrobe,presentincomposting．Culture-independentmethodsincludingphospholipidfattyacid(PU认)anddenaturinggradientgelelectrophoresis(DGGE)hadbeenemployedtocharacterizet

5、hechangesofbacterialcommunityduringthecompostingofagriculturalwaste．neresultsshowedthat：(1)ThestructureofmicrobialcommunityfromsamplesWasdiscretebythePLFAprofilemethod，whichsuggestedeachsampleownedindependentcharacteristicpattern．andsamplesselectedwererepresentative．nedataWascomprehensivetocharacte

6、rizethechangesofmicrobialcommunitystructureandmuchspecifictoevaluatemicrobialbiomass．However,thespeciescouldnotbedeterminedbythePLFAprofilemethod．(2)Thesuccessionofthebacterialcommunityincludedatleastthreedifferentstages．i．e．mesophilicmicrobialeommu—nity，thermophilicmicrobialcommunityandmaturationm

7、icrobialcommunity，bytheDGGEmethod．Also，theresultshowedthetemperatureplayedakeyroletoc}Iangesofmicrobialcommunityduringthecompostingprocess．(3)ThedifferencesrevealedbyPLFAprofileandDGGEmethodsindicatedthatob