四川烟区烤烟基因表达谱差异分析

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1、万方数据SichuanAgriculturalUniversityDissertationSubmittedinpartialfulfillmentofrequirementforM．ASTERDEGREEAnalysisofGeneExpressionProfileofFlue--curedTobaccoProducinginBy，XUwenshanDirectedbyLulimingCropGeneticsandBreedingOctober2013万方数据论文独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行

2、研究工作所取得的成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，学位论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得四川农业大学或其它教育机构的学位或证书所使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：躲欠舯yf3年忙月／9日关于论文使用授权的声明本人完全了解四川农业大学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川

3、农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。町笨话文不保密。(请在以上口内划“√”)研究生签名：徐文曲鲣卜导师签名口本论文保密，在年解密后适用本授权。p／3年阻月／j‘同瑚年阻月伴日舢7㈣叭圳8㈣0㈣2删1㈣O一㈣J～万方数据摘要烟草(Nicotianatabacum)是一种重要的叶用经济作物，在国民经济中占有重要的地位；同时，作为一个重要的模式植物，烟草在植物分子生物学、基因工程、细胞工程、植物组织培养、植物抗性研究等方面得到了广泛的应用。在烟叶生产中，烟叶的品质及产量不仅受其自身遗传因素的控制和栽培

4、措施的影响，而且受生态环境的制约，生态因素与烟叶品质密切相关。因此，探讨生态条件对烟草生长发育的影响，对了解烟叶品质形成的分子机制具有积极意义。本研究以四川烤烟主栽品种云烟87为试验材料，利用基因芯片技术，对宜宾、广元、凉山和攀枝花四个具有代表性的四』lf烤烟生态区烟叶进行了基因表达谱研究，包括基因表达量的统计、表达模式聚类分析、GO基因功能分析、Pathway信号通路分析等。本研究主要研究结果如下：1、以烟叶质量较好的米易为参照，在旺长期及打顶期，将兴文、剑阁、会理与米易鲜烟叶样品的基因表达谱进行对比分析。经过统计分析其显著性

5、差异表达基因的数目，发现四川烤烟不同生态区之间，基因的表达存在广泛的差异。旺长期：兴文、剑阁、会理与米易样本对比，显著性差异表达基因分别达到了2395个、2746个与1705个；其中上调表达基因分别为1315个、1463个与804个；下调表达基因分别为1080个、1283个及901个。以上三组对比中，共有的显著性差异表达基因为565个，其中上调表达321个，下调表达244个。打顶期：兴文、剑阁、会理与米易样本对比，显著性差异表达基因分别为1633个、2122个及1399个；其中上调表达基因分别为837个、1202个与692个；下

6、调表达基因分别为796个、920个及707个。以上三组对比中，共有的显著性差异表达基因为359个，其中上调表达192个，下调表达167个。2、不同生态区、不同生育期烟叶差异表达基因的GO分析表明，分子功能GO中共有catalyticactivity(催化反应)、transporteractivity(转运体)、binding(结合反应)等7个二级分类显著富集(P值≤0．05)：细胞组成GO中共有extracellularregion(细胞外区域)、cell(细胞)、membrane．enclosedlumen(膜关闭内腔)、en

7、velope(细胞膜)、organdie(细胞器)等9个二级分类显著富集(P值

8、s(光合作用)、Carotenoidbiosynthesis(类胡萝卜素生物合成)、Starchandsucrosemetabolism(淀粉和蔗糖代谢)、Flavonoidbiosynthesis(类黄酮生物合成)等17条差异基因显著富集的Pathway(P值