广州市男男性行为者中hiv-1感染者的基因亚型和耐药性研究

《广州市男男性行为者中hiv-1感染者的基因亚型和耐药性研究》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在学术论文-天天文库。

1、广东药科大学硕士研究生毕业论文分类号：___________密级:___________UDC:___________广州市男男性行为者中HIV-1感染者的基因亚型和耐药性研究姓名：张亚丽学号：2111541048院系：公共卫生学院专业：公共卫生专硕研究方向：疾病预防与控制导师姓名：夏云副教授韩志刚副主任医师论文提交日期：2018年3月15日论文答辩日期：2018年5月17日学位授予单位：广东药科大学二○一八年五月广东药科大学硕士研究生毕业论文I广东药科大学硕士研究生毕业论文StudyonHIV-1SubtypeandDrugResis

2、tanceinMenWhohaveSexwithMeninGuangzhouCandidate：ZhangYaliStudentID：2111541048Affiliation：SchoolofPublicHealthAcademicDegreeApliedfor：MasterofMedicineSpeciality：PublicHealthSupervisor：Pro.XiaYunAssistantSupervisor：Pro.HanZhigangDayofDefence：May2018Degree-Conferring-Instit

3、ution：GuangdongPharmaceuticalUniversityMay2018II广东药科大学硕士研究生毕业论文III广东药科大学硕士研究生毕业论文IV广东药科大学硕士研究生毕业论文V广东药科大学硕士研究生毕业论文广州市男男性行为者中HIV-1感染者的基因亚型和耐药性研究摘要目的：分析2008~2015年广州市男男性行为者（Menwhohavesexwithmen,MSM）中艾滋病病毒Ⅰ型（Humanimmunodeficiencyvirustype1,HIV-1）感染者的基因亚型和耐药性（Drugresistance,D

4、R）的分布特征与流行趋势。方法：收集现住址为广州市、经男男性行为途径传播感染、2008~2015年在广州市新确证为HIV-1抗体阳性且样本量大于140µl的血清样本。从收集的血清样本中提取HIV-1病毒RNA，采用巢式聚合酶链反应（Polymerasechainreaction,PCR）扩增病毒RNA的pol区全部蛋白酶基因（PR）和部分逆转录酶基因（RT）序列片段，将扩增成功的PCR产物送至第三方检测公司进行测序，测序结果通过Chromas软件进行查看、编辑和拼接。HIV-1基因亚型通过FastTree2.1.8软件的最大似然法（Ma

5、ximum-likelihood,ML）构建系统进化树进行确定，HIV-1耐药情况通过将拼接成功的序列导入美国斯坦福大学HIV耐药数据库（http://hivdb.stanford.edu）中使用HIVdb程序进行确定。使用SPSS20.0软件对所得数据进行统计学分析。结果：1.一般情况：根据纳入标准，基因亚型研究选取血清样本2473份，成功扩增2210份，2210份样本人群的平均年龄为30.19±8.22岁，最小16岁，最大84岁；汉族和未婚人群所占比率较高，分别为90.81%和73.39%。未接受抗病毒治疗的血清样本2283份，成功

6、扩增I广东药科大学硕士研究生毕业论文用于耐药性检测样本1986份，1986份样本人群的平均年龄30.18±8.24岁。2.HIV-1基因亚型分布情况：2008~2015年广州市MSM者中新确证的HIV-1感染者中存在多种HIV-1基因亚型，其中以CRF07_BC和CRF01_AE亚型所占比率较高，分别为38.22%和34.49%；其次为CRF55_01B、B、URFs、CRF59_01B和其他亚型，所占比率分别为14.62%、6.06%、3.58%、2.17%和0.63%。在不同年份间差异具有统计学意义的基因亚型有B、CRF55_01B

7、、CRF07_BC和URFs亚型，其中B亚型在所有亚型中所占比率在2008~2015年间呈逐年下降趋势（P＜0.001），URFs亚型呈逐年上升趋势（P＜0.000）。且在不同职业人群中，URFs在农民及农民工中所占比率最高，为9.26%。3.耐药性流行情况：2008~2015年在广州市新确证为HIV-1抗体阳性且未接受过抗病毒治疗的MSM者中HIV-1总耐药率为3.32%，其中蛋白酶抑制剂（PIs）、核苷类逆转录酶抑制剂（NRTIs）和非核苷类逆转录酶抑制剂（NNRTIs）三类药物耐药率分别为1.36%、0.65%和1.61%。所有亚

8、型中B亚型对三类药物的耐药率均较高，其中对D4T、EFV和NVP三种药物耐药率最高，均为4.17%，其次为NFV、AZT和RPV，均为3.33%。CRF55_01B对NNRTIs的耐药率较高，尤其对EFV和