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《利用ssr标记对12个啤酒大麦品种的聚类分析和主坐标分析》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在教育资源-天天文库。
1、第30卷第3期河北农业大学学报Vol.30No.32007年5月JOURNALOFAGRICULTURALUNIVERSITYOFHEBEIMay.2007文章编号:1000-1573(2007)03-0026-06利用SSR标记对12个啤酒大麦品种的聚类分析和主坐标分析11,2112¹张大乐,李锁平,雷进生,刘萍,马正强(1.河南大学农业生物技术研究所,河南开封475001;2.南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095)摘要:为啤酒大麦育种实践提供可靠的信息,采用SSR标记技术对12个已知来源的啤酒大麦品种的遗传背景进行了遗传
2、多样性分析。从筛选出的25对有多态性的SSR引物中共扩增出160个等位位点,其中136个位点有多态性,占8510%,每对引物可扩增出1~13个位点,平均5144个等位位点。聚类分析表明,在SM相似系数0163水平上12个啤酒大麦品种可聚成3类2组。主坐标分析将其分为2类4组。2种分类方法所获得结果基本一致,但主坐标分析更能较为真实的反映12个啤酒大麦品种间的亲缘关系。关键词:啤酒大麦;SSR;聚类分析;主坐标分析;遗传多样性+中图分类号:Q75;S512.31文献标识码:AClusterandprincipalcoordinateanalysisamon
3、g12beerbarleybySSRs11,2112ZHANGDa-le,LISuo-ping,LEIJin-sheng,LIUPing,MAZheng-qiang(1.AgriculturalBiotechnologyInstitute,HenanUniversity,Kaifeng475001,China;2.NationalKeyLaboratoryofCropGeneticsandGermplasmEnhancement,NanjingAgriculturalUniversity,Nanjing210095,China)Abstract:Theg
4、eneticrelationshipsamong12beerbarleyvarietieswithknownoriginwereanalyzedbySSRstoprovidecrediblegeneticinformationinbreedingbeerbarly.160distinctivelociintotalwereamplifiedfrom25pairsofSSRprimers,and136werepolymorphic,whichaccountedfor8510%.1to13polymorphiclocicouldbeamplifiedfrom
5、eachprimer,withanaverageof5144.The12beerbarleyvarietiescouldbeclassifiedinto3groupsand2subgroupsatthelevelofSM=0163byclusteranalysis,while2groupsand4subgroupscouldbesortedbyprincipalcoordinateanalysis.Thetwomethodsaboveexhibitedsimilarphylogenesisamongthetestedcultivars.Howev-er,
6、moreauthenticgeneticrelationshipamongthe12beerbarleyvarietiescouldbeprovidedbytheprincipalcoordinateanalysis.Keywords:beerbarley;SSR;clusteranalysis;principalcoordinateanalysis;geneticdiversity大麦(Hordeumvulgave)是世界上仅次于小近年来,随着我国啤酒工业的迅猛发展,对啤酒大麦麦、水稻、玉米的第四大谷类作物。按照其在生产上的品质要求越来越高。然而,长期
7、的遗传定向改良,[1]的用途,主要分为啤酒大麦和饲料大麦两大类。致使我国推广的啤酒大麦品种的遗传基础比较单¹收稿日期:2006-12-09基金项目:南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室开放课题作者简介:张大乐(1979-),男,河南辉县人,助教,研究方向为植物分子遗传学.通讯作者:李锁平(1962-),男,河南商丘人,教授,从事植物分子细胞遗传学.E-mail:Lisp369@163.com第3期张大乐等:利用SSR标记对12个啤酒大麦品种的聚类分析和主坐标分析27一,其遗传背景日趋一致。另外,我国长期以来在选1.2方法育大麦品种上,一直以啤用品
8、种和饲用品种兼用为1.2.1总DNA的提取每份材料播种5~10粒主要目标。这就造
