福建省临床分离分枝杆菌菌种鉴定研究

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1、分类：R378.91学校代码：10392学科专业代码：100103学号：200903133福建医科大学硕士学位论文福建省临床分离分枝杆菌菌种鉴定研究StudyonspeciesidentificationofclinicalmycobacteriumisolatesfromFujianprovince,China学位类型：医学硕士所在学院：基础医学院申请人：黄明翔学科、专业：病原生物学导师：佘菲菲教授研究起止日期：2011年11月至2013年3月答辩日期：2013年6月7日二○一三年六月目录缩略词……………………………………………………………………………1中文摘要………

2、…………………………………………………………………2英文摘要…………………………………………………………………………4前言………………………………………………………………………………6材料与方法………………………………………………………………………9结果………………………………………………………………………………15讨论………………………………………………………………………………26结论………………………………………………………………………………32参考文献…………………………………………………………………………33综述…………………………………………………………………

3、……………38攻读硕士学位期间发表的论文…………………………………………………48致谢………………………………………………………………………………49缩略词缩略词英文全称中文全称TBtuberculosis结核病MTBMycobacteriumtuberculosis结核分枝杆菌MTBCMycobacteriumtuberculosiscomplex结核分枝杆菌复合群NTMnontuberculousmycobacterium非结核分枝杆菌AFBacid-fastbacilli抗酸杆菌MDRmultidrugresistance耐多药XDRextensivelydrug

4、resistance广泛耐药PCRpolymerasechainreaction聚合酶链反应RFLPRestrictionfragmentlengthpolymorphism限制性片段长度多态性PRAPCR-RFLPanalysisPCR-RFLP分析PNBp-nitrobenzoicacid对硝基苯甲酸TCH2-thiophenecarboxylicacidhydrazide噻吩-2-羧酸肼Spoligotypingspaceroligonucleotidetyping间隔区寡核苷酸分型VNTRvariable-numbertandem-repeat数目可变串联重复序

5、列MLVAmultilocusVNTRanalysis多位点VNTR分析SDSsodiumdodecylsulfate十二烷基硫酸钠CTABcetyltrimethylammoniumbromide十六烷基三甲基溴化铵EBethidiumbromide溴化乙锭PBSphosphatebufferedsaline磷酸盐缓冲液Tristrishydroxymethylaminomethane三羟甲基氨基甲烷EDTAethylenediaminetetraaceticacid乙二胺四乙酸DNAdeoxyribonucleicacid脱氧核糖核酸bpbasepair碱基对min

6、minute分ssecond秒mlmillilitre毫升µMmicromolar微摩/升1福建省临床分离分枝杆菌菌种鉴定研究中文摘要目的评价结核分枝杆菌抗原胶体金法和涂片形态学特征初步鉴别临床分离分枝杆菌菌种的应用价值；分析临床分离非结核分枝杆菌（NTM）菌种，探讨福建省NTM临床分离率和菌种分布情况。方法应用涂片形态学特征和结核分枝杆菌抗原胶体金法对3681株临床分离分枝杆菌进行结核分枝杆菌复合群（MTBC）与NTM鉴别并与传统PNB法结果进行比较；应用hsp65-和rpoB-PCR-RFLP对鉴别出的NTM菌株进行菌种鉴定。结果3681株临床分离分枝杆菌共鉴别出4

7、05株NTM，NTM临床分离率为11.0%。以传统PNB/TCH鉴别培方法作为金标准，应用涂片形态学特征鉴别MTBC与NTM的符合率为98.9%、敏感度为98.4%（3225/3276）、特异度为95.8%（388/405）、阳性预测值为99.97%和阴性预测值为91.2%；结核分枝杆菌抗原胶体金法的符合率为98.2%、敏感度为98.8%（3237/3276），特异度为99.7%（404/405）、阳性预测值为99.5%和阴性预测值88.4%；结合两种方法进行判断，当两种方法均为阳性，可报告菌株为MTBC，其阳性预测值为100.0%；两种