基于量子算法的苹果及pcd相关蛋白亚细胞定位体系研究

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1、ShandongAgriculturalUniversityPh．D、．DISSERTATIONTheStudyofProteinSubcellularLocalizationofMalus×DomesticaBorkh．andPCDBasedonQuantumAlgorithmDepartment：CollegeofHorticultureScienceandEngineeringMajor：MolecularBioinformaticsinFruitCropsPh．D．Candidate：LiuZhiXiIlSupervisor：Pro￡YangHongqiang

2、June14th，2013关于学位论文原创性和使用授权的声明本人所呈交的学位论文，是在导师指导下，独立进行科学研究所取得的成果。对在论文研究期间给予指导、帮助和做出重要贡献的个人或集体，均在文中明确说明。本声明的法律责任由本人承担。本人完全了解山东农业大学有关保留和使用学位论文的规定，同意学校保留和按要求向国家有关部门或机构送交论文纸质本和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权山东农业大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文和汇编本学位论文，同时授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数

3、据库》，并向社会公众提供信息服务。保密论文在解密后应遵守此规定。论文作者签名：导师签名：扒％缸业了缸Et期：兰!兰：6、f中符号说明Blast：thebasiclocalalignmentsearchtool，在生物数据库中进行相似性比较的分析工具BP：backpropagation，反向传播Caspase：cysteinylaspartate-specificproteinases，胱天蛋白酶DNA：deoxyribonucleicacid，脱氧核糖核酸EST：expressedsequencetag，表达序列标签FunD：functiondomain，功能域GFP

4、：greenfluorescentprotein，绿色荧光蛋白GO：geneontology，基因本体GOA：geneontologyannotation，基因本体注释KNN：Knearestneighbor，K近邻ML：multiplelabel，多标签／V[D：Malusxdomestica，苹果NCBI：nationalcenterforbiotechnologyinformation，美国国立生物技术信息中心ORF：openreadingframe，开放阅读框PCD：programcelldeath，程序性细胞死亡PCR：polymerasechainreac

5、tion，聚合酶链式反应PDB：proteindatabasebank，蛋白结构数据库PG：proteingranularity，蛋白粒度PGI：proteingranularityincrement，蛋白粒度增量QNN：quantumneuralnetworks，量子神经网络QP：quadraticprogramming，二次规划RBF：radialbasisfunction，径向基函数SL：singlelabel，单标签SVM：supportvectormachine，支持向量机VPE：vacuolarprocessingenzyme，液泡加工酶WGS：whole

6、genomeshotgun，全基因组鸟枪法目录中文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．I英文摘要⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．Ⅲ第一章前言⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯l1．1细胞程序性死亡及其相关蛋白与亚细胞单标签定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．11．1．1植物细胞程序性死亡及其相关蛋白⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．11．1．2果树细胞程序性死亡及其相关蛋白⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．21．1．3细胞程序性死亡相关蛋白亚细胞单标签定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯

7、⋯⋯⋯⋯⋯⋯31．2植物蛋白与亚细胞多标签定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．41．2．1植物基因测序与植物蛋白⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯41．2．2植物蛋白亚细胞多标签定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯51．3果树全基因组蛋白与亚细胞定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯．．61．3．1全基因组蛋白亚细胞定位⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯61．3．2果树基因测序与果树蛋白⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯61．4研究目的和意义⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯⋯