xrcc2基因snps多态性与结直肠癌关系的研究

xrcc2基因snps多态性与结直肠癌关系的研究

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1、中图分类号:R36;R735.3;R730.2硕士学位论文XRCC2基因SNPs多态性与结直肠癌关系的研究院(系)、所基础医学院研究生姓名张杰东学科、专业病理学与病理生理学导师姓名孙兴旺教授二Ο一三年四月目录1XRCC2基因SNPs多态性与结直肠癌关系的研究……………11.1中文摘要………………………………………………………11.2英文摘要………………………………………………………51.3前言……………………………………………………………91.4材料与方法……………………………………………………121.5结果………………………………………………………

2、……251.6讨论……………………………………………………………341.7结论……………………………………………………………391.8参考文献………………………………………………………401.9英汉缩略词对照表……………………………………………442致谢……………………………………………………………453结直肠癌单核苷酸多态性研究现状(综述)…………………………………………………………………462XRCC2基因SNPs多态性与结直肠癌关系的研究摘要目的:通过检测XRCC2基因C41657TG4234C单核苷酸多态性在结直肠癌(ColorectalCa

3、ncer,CRC)患者及正常对照者中的基因型及等位基因频率的分布,研究XRCC2基因C41657TG4234CSNPs与CRC易感性的关系,以及与CRC患者临床病理学参数之间的相关性;探讨C41657T多态性对XRCC2蛋白在CRC组织和正常组织中表达的影响。方法:采用病例-对照研究的方法,病例组为246例汉族结直肠癌患者,对照组为同期体检健康者262例,抽取外周静脉血2ml,同时调查其个人资料、病史及临床病理学参数。使用酚-氯仿-异戊醇法提取外周血基因组DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(polymerasechainreaction-

4、restrictionfragmentlengthpolymorphism,PCR-RFLP)检测XRCC2基因C41657TG4234CSNPs的基因型及等位基因的分布,连锁不平衡与单体型分析用SHEsis在线软件进行,比较结直肠癌患者C41657T位点各基因型与肿瘤临床病理参数之间的关系。收集病例组结直肠癌肿瘤组织50例和正常大肠组织36例,免疫组织化学(Immunohistochemistry,IHC)技术检测肿瘤组织及正常组织中XRCC2蛋白的表达,卡方检验分析蛋白表达的差异。C41657T和G4234C各基因型与结直肠癌的患病风险采用log

5、istic回归分析,计算相对危险度比值比(oddsratio,OR)和95%可信区间(95%confidenceinterval,95%CI)。采用SPSS11.5软件包进行统计,以P<0.05为有统计学意义。结果:(1)结直肠癌患者和对照组在性别、年龄、吸烟史、饮酒量无统计学差异;XRCC2基因C41657T1及G4234C位点基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。(2)XRCC2基因C41657T位点CC、CT、TT各个基因型在病例组和对照组中的频率分别为63.4%、33.3%、3.3%和74.0%、23.3%、2.7%

6、,两组间的基因型频率分布不同,差异具有统计学意义(P<0.05);C、T等位基因在病例组和对照组的基因频率分别为80.1%、19.9%和85.7%、14.3%,两组间比较有显著性差异(P<0.05)。XRCC2基因G4134C位点GG、GC、CC各基因型在病例组和对照组中的频率分别为67.5%、30.1%、2.4%和72.9%、24.8%、2.3%,两组间的基因型频率分布无明显统计学差异(P>0.05);G、C等位基因在病例组和对照组的基因频率分别为82.5%、17.5%和85.3%、14.7%,两组间比较无显著性差异(P>0.05)。(3)XRCC

7、2基因C41657TSNP与结直肠癌的发病风险相关:与CC基因型相比,CT合并TT基因型显著增加结直肠癌的患病风险(OR=1.646,95%CI=1.127~2.404),而C等位基因为个体患结直肠癌的保护性因素。XRCC2基因C41657TSNP与结直肠癌的发病风险无关:与GG基因型相比,GC合并CC基因型不能增加结直肠癌的患病风险(OR=1.296,95%CI=0.885~1.898)。(4)应用SHEsis在线软件对XRCC2基因C41657T和G4234C两个SNP位点进行连锁不平衡及单体型分析显示,XRCC2SNP间存在连锁不平衡现象(D'

8、=0.184,r2=0.032,P=1.62e-8)。XRCC2的4种单体型的分布在结直肠癌患者与正常对照组

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