凉山和秦岭大熊猫遗传多样性的微卫星分析

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1、凉山和秦岭大熊猫遗传多样性的微卫星分析专业名称：生物化学与分子生物学申请人：吉建飞指导教师：周岐海主席：。，。委员：一⋯_一—_—■～一趣⋯鍪～．露f：基廷一惫盐他；凉山和秦岭大熊猫遗传多样性的微卫星撕㈣Y258删5076作者姓名：吉建飞年级：201l级指导教师：周岐海教授专业：生物化学与分子生物学研究方向：分子系统学摘要大熊猫是中国特有的珍稀濒危动物，目前仅分布于秦岭、氓山、邛崃、凉山、大相岭和小相岭山系。栖息地丧失和破碎化对大熊猫的严重影响己引起世界的广泛关注，有必要了解该物种的遗传背景以制定有效的保护和管理策略。本研究利

2、用12对微卫星位点作为分子标记对大熊猫的遗传多样性和种群历史进行了分析和探讨，拟为大熊猫的保护和管理对策提供科学依据。本研究于2012年分别从秦岭和凉山采集到90份和59份粪便样品，微卫星分析发现秦岭90份粪便DNA样品来自于33只大熊猫个体，凉山59份粪便样品来自于24个大熊猫个体。SRY基因性别鉴定引物发现秦岭大熊猫雌性个体10只，雄性个体23只，凉山大熊猫雌性个体10只，雄性个体14只。秦岭和凉山两个山系的大熊猫都具有较丰富的遗传多样性。秦岭山系个体平均等位基因数为4．417，观察杂合度(Ho)为0．4510，期望杂合度

3、(HE)为0．4390，平均PIC值为0．4101。凉山山系个体的平均等位基因数4．2500，观察杂合度(Ho)r为0．6250，期望杂合度(HE)为0．6110，平均PIC值为0．5525。两个山系都明显的偏离了Hardy-Weinberg平衡。K检验显示微卫星A1TIe—u11、A1TIe一!．t24和AYl61195三个位点呈现明显的单峰分布，推断大熊猫种群在历史上可能经历过种群扩张。Bottleneck杂合度检验和模型转换检验结果显示秦岭山系大熊猫没有经历过种群瓶颈，而凉山山系大熊猫可能经历了种群瓶颈。关键词：大熊猫；

4、微卫星；遗传多样性；种群动态MicrosatelliteAnalysisaboutGeneticDiversityofGiantPandainLiangshanandQinlingMountainsAuthor：JiJianfeiSupervisor：Pro．ZhouQihaiGrade：2011Major：BiochemistryandMolecularBiologyResearchDirection：MolecularsystematicsAbstractGiantpandaisarareandendemicanimali

5、nchina,whichonlydistributedinQhaling，Qionglai，Liangshan，Minshan，DaxianglingandXiaoxianglingmountainsatpresent．Thehabitatlossandfragmentationeffectingaboutgiantpandahasarousedwidespreadconcernintheworld．itisnecessarytokonwthegeneticbackgroundofthespeciesinordertomake

6、effectiveconservationandmanagementstrategies．Inthisstudy，weuse12microsateltitelociasmolecularmarkerstoanalyzeanddiscusesthegeneticdiversityandpopulationhistoryofgiantpandas，inordertoprovidescientificbasisfortheprotectionofgiantpandas。Wecollected90fecalsamplesfromQin

7、lingMountainsand59fecalsamplesfromLiangshanMountainsin2012．TheQinling90fecalsamplesofDNAarefrom50giantpandas，theLiangshan59fecal．samplesarefrom36giantpanda．SRYgenesexidentificationprimersstudyIndicatethatthereare10femalegiantpandaand23malegiantpandainQinlingMountain

8、s，thereare10femalegiantpandaand14malegiantpandainLiangshanMountains．InLiangshanMountains，theaverageallelenumberwas4．2500，theaverageobserve