应用微卫星dna标记进行秦岭川金丝猴亲子鉴定和遗传多样性研究

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1、应用微卫星DNA标记进行秦岭川金丝猴亲子鉴定和遗传多样性研究任轶指导教师：蒙世杰教授(西北大学生命科学学院，西安，710069)摘要川金丝猴(Rhinopithecusroxellana)是我国特有灵长类动物。因受到人类狩猎和生境片段化的威胁而处于濒危境地。为了采取有效的保护措施，有必要从遗传学角度来研究它的遗传多样性、种群结构。本研究用分子遗传标记对金丝猴孤立种群亲缘关系进行研究，‘这对于珍稀濒危动物的保护与管理将是有巨大意义的。本文利用人的17个微卫星位点，在秦岭川金丝猴DNA基因组中进行扩增得到6个微卫星位点(D6S271，

2、D6S287，D6S311，DllSl366，D17S1290，D6S493)具有较明显的多态性。将秦岭川金丝猴与人的微卫星序列进行了比较，表明两者具有较高的同源性，说明了微卫星两侧序列具有高度保守性，而核心序列具有高度多态性，是适合于在物种间相互扩增的。在84只金丝猴样品中，6个微卫星位点共得到36种等位基因，其中D6S287最多，有12种等位基因，根据位点的等位基因频率，计算了各个位点的基因杂合度、多态信息含量及其平均值。基因杂合度处于0．523"-'0．838，平均为0．684；多态信息含量处于0．348-．-0．710，平

3、均为0．548，表明6个位点大多具有高度多态性，而且种群具有较好的遗传多样性。同时发现，基因杂合度与多态信息含量具有一定的正相关性。计算得到各个位点的第一非亲排除力处于O．101-4)．354之间，累积可达0．797684：第二非亲排除力处于O．174---0．533之间，累积可达0．943441。利用筛选到的6个多态性微卫星位点成功的对笼养和野生孤立种群金丝猴进行了亲子鉴定。本研究中，利用微卫星标记技术与非损伤性取样DNA分析结合的方法进行了较大量的个体分析，通过组织样品与毛发样品的比较，发现只要毛发样品达到3巧根以上均可得到理

4、想效果。该方法具有高灵敏度、操作简单、非损伤等特点，解决了野生珍稀濒危物种难以取样，无法进行大规模研究的难题。为了保护金丝猴这一濒危物种，应该建立其遗传谱系，以避免或减少近亲交配、保持遗传多样性。关键词：川金丝猴，非损伤性DNA分析，微卫星标记，亲子鉴定，遗传多样性。lIParentageandGeneticDiversityStudiesinSichuansnub—nosedmonkey(Rhinopithecusroxellana)UsingMicrosatelliteDNAMarkersRenYiAdvisor：MengSh

5、ijie7(CollegeofLifeScience,NorthwestUniversity,Xi。an，710069)ABSTRACTSichuansnub-nosedmonkey(Rhinopithecusroxellanae)isendemictoChina．Becauseofthehuman'sactionsuchasdeforesting，Snub-nosedmonkeycurrentlythreatenedbyhabitatloss，ffagmentation．Inordertodeviseefficiencycons

6、ervationandmanagementstrategiesforthisendangeredspecies，itisnecessarytounderstandthegeneticstructureandmolecularphylogeography．Inthisinvestigation，westudiedparentageandgeneticdiversityinSichuananub-nosedmonkey(Rhinopithecusroxellana)isolatepopulationusingmierosatdlite

7、DNAmarkers，itwassignificanttoprotectandmanageendangeredspecies．Inthisinvestigation，17polymorphicmierosatelliteDNAprimersidentifiedinhumanwereampfifiedinSichuananub-nosedmonkeygenomes，andfoundthat8oftheselocididnotamplifyproduct，3weremonomorphicand6(D6S271，D6S287，D6S31

8、1，DllSl366，D17S1290，D6S493)werepolymorphic．Wecompared2microsatellitelocisequencesfromhumanandmonkey，itshowedthattheseweresan