中国东南沿海青蟹遗传多样性微卫星的分析

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1、浙江大学硕士学位论文摘要中国东南沿海青蟹遗传多样性的微卫星分析摘要青蟹足我国东南沿海重要的海洋经济蟹类之一。为了解我国东南沿海青蟹的种质资源现状,本文利用微卫星分子标记研究了中国沿海杭州湾、三门湾、闽江口、东山湾、珠江口、北部湾、清澜港以及越南湄公河口8个青蟹野生群体的遗传多样性和遗传分化水平,为我国青蟹种质资源的可持续利用、保护以及良种培育提供了基础资料。17对微卫星引物在8个青蟹野生群体中共检测出255个等位基因。等位基因数10"~22,平均等位基因数15:有效等位基因数5.24~13.50,平均有效等位基因数8.56

2、;期望杂合度O.811~O.928,平均为0.8751多态信息含量PIC介于O.784---0.921,均具有高度多态性,由此表明本研究所用的微卫星标记均可作为有效的遗传标记用于青蟹遗传多样性的评估。评估了8个青蟹野生群体共278个个体的遗传多样性。8个群体平均多态信息含量O.770~O.811,平均等位基因数9.41~10.94,平均有效等位基因数5.42"-6.87,期望杂合度0.810""0.843,说明我国东南沿海青蟹野生群体的遗传多样性较丰富。其中,浙江杭州湾群体遗传多样性最高,三门湾、海南清澜港、越南、广东珠江

3、口、广西北部湾次之,而福建闽江口与东山湾群体遗传多样性相对较低。此外,136个群体位点组合中(8群体×17位点),11.03%符合Hardy.Weinberg平衡(尸>O.05),88.97%显著偏离平衡(尸<0.05)。8个群体均存在一定的杂合子缺失现象,可能是由无效等位基因或人为过度捕捞等因素造成的。分析了8个青蟹群体间的遗传分化水平以及基因交流情况。群体间遗传分化系数尽7'值为0.0355"~0.0817,AMOVA分析显示,5.96%的遗传变异存在于群体间,94.04%的遗传变异存在于群体内,表明我国东南沿海青蟹群

4、体间遗传分化水平不高。群体间的基因流值为2.8120"--6.7780,说明青蟹群体间基因交流较频繁。青蟹不同地理分布群体间的遗传分化水平中等偏低,基因交流程度较高,可能与青蟹的习性有关。探讨了青蟹群体间的系统发生关系以及东南沿海青蟹的地理分布格局。群体间遗传相似系数为O.5644"0.7765,遗传距离为0.2530"0.5719,其中,我国7个青蟹群体间亲缘关系的远近与其地理分布足大致相符的,可为青蟹遗传育种提浙江大学硕一t学他论文摘要供理论依据。由遗传距离构建的UPGMA图显示,8个青蟹群体共分为3支,浙江杭州湾首先

5、与三门湾聚在一起,再与福建闽江口、福建东山湾聚在一起,最后与越南湄公河口群体聚为第一支;广东珠江口群体与海南清澜港群体聚为第二支:广西北部湾群体则单独聚为第三支。由此,可推测简单的距离隔离模式并不能解释青蟹的群体遗传结构特征,东南沿海的青蟹群体并没有出现明显的地理分布格局。关键词:拟穴青蟹;微卫星标记;遗传多样性;遗传分化浙江大学硕士学化论文AbstractMicrosatelliteAnalysisonGeneticDiversityofEightWildPopulationsofScyllaparamamosainAl

6、ongtheCoastofSoutheasternChinaAbstraetThemudcrab,Scyllaparamamosain,wasoneofthemosteconomicallycrabsalongthecoastofsoutheasternChina.Thisspecieswasextensivelyharvested,asaconsequence,itspopulmionswereinconstantdecline.InordertoassessthegermplasmresourcesofSparamam

7、osaininChina,weinvestigatedthegeneticdiversityof8representativepopulations,collectedfromHangzhouBay(I-IX),SanmenBay(SM),MinjiangEstuary(MJ),DongshanBay(DS),ZhejiangEstuary(GD),BeibuGulf(GX),QinglanEstuary(Hl彤ofChinaandMekongRiverEstuaryofVietnam(YN).Thenumberofall

8、eles似),numberofeffectivealleles(M),polymorphisminformationcontent(PIC)andexpectedheterozygosity(皿)werealldetermined.TheHardy—WeinbergEquilibriumWascheck

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