猪动静脉血液mirna表达谱分析

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1、万方数据SichuanAgriculturalUniversityMasterDegreeDissertationMicroRNAomesofPorcineArteriaIandVenousBloodAuthor：BailuSupervisor：Prof．BailinMajor：AnimalBreedingandGeneticsSpecialty：PigBreedingandGenetics2014．6万方数据论文指导小组成员㈣㈣㈣

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5、lⅧ㈣mJO12127本研究得到教育部长江学者和创新团队发展

6、计划(IRTl3083)资助四川农业大学“畜禽遗传资源发掘与创新利用四川省重点实验室”完成万方数据论文独创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文是我个人在导师指导下进行研究工作所取得的成果。尽我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，学位论文中不包含其他个人或集体已经发表或撰写过的研究成果，也不包含为获得四川农业大学或其它教育机构的学位或证书所使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名：佃鼹护／犯年6月li日关于论文使用授权的声明本人完全了解四川农业大

7、学有关保留、使用学位论文的规定，即：学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和电子版，允许论文被查阅和借阅，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意四川农业大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。口本论文不保密。口本论文保密，在一年解密后适用本授权。(请在以上口内划“√”)研究生签名：导师签名：倒荔谛扎：b／牛年6月11日良心／够年石月／，／，日万方数据摘要MicroRNAs(miRNAs)是一类长度约18～24nt的非编码RNA，能够与mRNA特异性结合从而

8、调控基因的表达，在细胞增殖、分化、代谢、凋亡和免疫应答等生物学过程中具有重要作用。血液作为最重要的体液广泛参与机体各个生物学过程，血液中的miRNAs被报道能稳定的存在于血液中作为生物体生理状态和病理状态的重要分子标记。然而目前对于猪血液miRNA的研究相对较少，且都是对静脉血液miRNA的研究，对于动脉血液中miRNA研究还完全是空白。为了鉴定猪血液miRNA表达谱和动静脉血液在miRNA表达水平的差异，我们利用高通量测序技术检测了猪的动脉血液和静脉血液的miRNA表达谱，并用荧光定量方法进行验证。结果如下：(

9、1)通过建库测序，分别在动脉血液和静脉血液获得了5．21millionfM)和8．61M原始数据。经过滤后，超过78％的序列达到质量要求成为mappable序列，这些mappable序列长度集中在21～23nt。(2)两个文库共鉴定出272个猪已知的miRNAs，52个保守的miRNAs和281个候选miRNAs，其中表达量位于前20位的miRNAs分别占据动脉血液和静脉血液全部序列的85．35％和84．75％。(3)在表达量前20的miRNAs中有17个是在两个文库中共同表达的，通过靶基因预测和KEGG通路分析

10、发现在血液中高表达的miRNAs主要与红细胞的生成以及血管生成相关。(4)用IDEG6对两个文库中的miRNAs进行差异分析得到57个差异表达的miRNAs(p

11、应过程相关，而静脉血液富集的miRNAs与细胞凋亡和低氧诱导过程相关。以上结果为猪的miRNA研究提供了新的参考数据，同时也奠定了猪血液miRNA研究的基础，并为基于血液研究的分子标记提供了依据。关键词：猪，动脉血液；静脉血液；miRNA；高通量测序万方数据AbstractMicroRNAs(miRNAs)，aclassof18-24nucleotidenoncodingRNAs，regulategeneexpressionbyspecificallybindingwithtargetmRNAandareinvo

12、lvedinavarietyofcellularbiologicalprocesses，suchascellproliferation，celldifferentiation，cellmetabolism，cellapoptosisandimmuneresponse．Asthemostimportantbodyfluid，bloodplaysanimportantrole