基于苹果est-ssr的梨种质资源遗传多样性分析

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1、西北植物学报,2010,30(4):0690—0696AetaBot.Borea1.-Occident.Sin.文章编号:1000—4025(2010)04—0690—07基于苹果EST—SSR的梨种质资源遗传多样性分析路娟,吴俊,张绍铃,吴华清,张妤艳(1南京农业大学园艺学院,南京210095;2江苏省农业科学院园艺研究所,南京210014)摘要:利用来自苹果的8对EST—SSR标记对48份梨(Pr)种质资源进行遗传多样性研究,以分析其在梨属植物上的通用性。结果表明,8对EST-SSR引物在供试材料上均能扩增出与苹果大

2、小相似的产物,所有引物共检测到140个基因位点,其中多态性位点129个,多态性比例为92.14X,并且可成功区分不同品种。根据EST—SSR标记所揭示的多态性和uP—GMA法聚类分析,48份梨种质资源在相似系数0.62处可分为东方梨和西方梨两个种群,而中国的白梨(PyrusbretschneideriRehd.)、砂梨(P.pyrifoliaBurm.f.Nakai)和秋子梨(P.ussuriensisMax—im.)相互交错在一起,没有独自成组。可见,苹果的EST—SSR标记在梨上具有高度的可转移性,可应用于梨属植物的

3、资源评价及遗传关系研究。关键词:苹果;EST—SSR;梨;遗传多样性中图分类号:Q789文献标识码:AAnalysisofGeneticDiversityinPearGermplasmUsingAppleEST-SSRsLUJuan,WUJun,ZHANGShao—ling,WUHua—qing,ZHANGYu—yan。(1CollegeofHorticulture,NanjingAgriculturalUniversity,Nanjing210095,China;2InstituteofHorticulture,Jia

4、ngsuAcademyofAgriculturalSciences,Nanjing210014,China)Abstract:Eightsimplesequencerepeatmarkersderivedfromexpressedsequencetags(EST—SSRmarkers)ofapple(Maluspumila)wereselectedforanalysistheirapplicationongeneticdiversityamong48cultivarsinpear(Pyrus).Theresultssho

5、wedthateightEST~SSRprimerpairsgaveanamplificationproductwhentestedonallpearcultivars,andthesizeofamplificationbandsweresimilartothoseofapple.Inthisstudy,140genelocuswerescreenedbyallEST—SSR,ofwhich129(92.14)werepolymorphic,anddifferentcul—tivarscouldbedistinguish

6、edsuccessfully.Therefore,EST—SSRmarkersdevelopedfromappleshowedhightransferabilityinpear,anditwouldbesuitableforapplicationingermplasmevaluationandgeneticrelation—shipanalysisofpear.BasedonpolymorphismrevealedbyEST—SSRmarkers,UPGMAclusteranalysiswasperformedbysof

7、twareNTY—SIS—pc2.01,thecladesformedtwopopulations,orientalandoccidentalpopula—tion,atthedicecoefficientof0.62.PyrusbretschneideriRehd.,P,ussuriensisMaxim.andP.pyrifoliaBurm.f.NakaioriginatedinChinaintervenedeachotherandcouldnotformgroupindependently.Keywords:appl

8、e(Maluspumila);EST—SSR;pear(Pyrus);geneticpolymorphism收稿日期:20091卜26;修改稿收到日期:2010—03—19基金项目:国家公益性行业(农业)科研专项(200903044)作者简介:路娟(1983一),女(汉族),在读硕士生,主要从事果树分子生物学研究。E

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