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1、山羊皮肤组织SCF基因克隆和序列研究摘要：对山羊SCF基因的结构与序列进行了分析，参考山羊和绵羊SCF基因序列设计引物，利用PCR克隆获得了山羊SCF基因的两个剪接体序列，同时对其进行了生物信息学分析。结果表明，山羊SCF基因分泌型和跨膜型编码区长度分别为825bp和741bp,长度差异主要是由外显子6缺失/插入引起的，与绵羊和牛的同源性分别为98%和97%O13个物种的SCF基因的系统发育聚类与动物分类学基本一致。关键词：山羊；SCF基因；分泌型；跨膜型中图分类号：S827；Q785文献标识码：A文章编号：0439-8114(2014)02-0450-03Cloni
2、ngandSequenceAnalysisofSCFGeneinGoatSkinTissueZHANGJun-jiel,XIJian-zhongl,ZHOURong-yanl,2,LIXiang-longl,2,LILan-huil,CHENHuil,ZHANGZhen-hongl,ZHAOZhu-junl,2(1.CollegeofAnimalScienceandTechnology,AgriculturalUniversityofHebei,Baoding071001,Hebei,China；2.EmbryoEngineeringandTechnologicalC
3、entreofCattleandSheepofHebeiProvince,Baoding071001,Hebei,China)Abstract:ToinvestigatethestruetureandsequenceofSCFgeneingoat,primersweredesignedbasedonthesequenceofgoatandsheep.TwotranscriptspliceswereobtainedwithPCRandcloningandbioinformaticsanalysisofthesequencewasmade・TheresuItsshowed
4、thatthelengthofcodingsequenceofsolubleandtransmembraneSCFgeneingoatis825bpand741bp,respectively.Thelengthdiffereneewasduetothedeletion/insertionof6thexon.TheidentityofSCFgenebetweengoatandsheeporcattlewas98%and97%,respectively.ThephylogeneticclustersbasedonSCFgenesequenceofthirteenspeci
5、eswerethesameasthezootaxy.Keywords:goat；SCFgene；solubletype；transmembranetype哺乳动物毛色是由体内黑色素决定的，黑色素包括真黑素(Eumelanin)和褐黑素(Phenomelanin)。真黑素使毛发表现为褐色和黑色，褐黑素使毛发表现为黄色和红色，两种色素分布与比例的不同表现为哺乳动物不同的毛色类型。黑色素存在于黑素细胞的黑素体中，这些黑素体在被毛的生长过程中通过胞吐作用转移至被毛，黑素细胞的增殖与分化是黑色素产生的关键。皮肤中的干细胞因子(Stemcellfactor,SCF),也称为kit
6、配体或青灰因子，主要来源于角质形成细胞，由于转录过程中存在着差异，干细胞因子在体内以分泌型(s-SCF)和跨膜型(tm-SCF)两种形式存在，通过其受体c-kit介导细胞的增殖、分化等生物学功能。SCF/c-kit信号通路在调节黑素细胞的存活、分化、移行和增殖等过程中起重要作用[1]。在哺乳动物中毛色是绒、毛、羔皮及裘皮用山羊的重要经济性状，也是识别个体、血液系统和品种归属的遗传标志之一。因此，本研究克隆了山羊皮肤组织中的SCF基因序列，同时进行了结构分析，并基于测定序列构建了进化树，为进一步研究SCF基因在毛色形成中的功能奠定了基础。1材料与方法1.1材料EasyP
7、ureRNAKit、pEASY-T3CloningKit和感受态细胞Transl-Tl购自北京全式金生物技术有限公司；ReverseTranscriptaseM-MLV(RNaseH-)、RecombinantRibonucleaseInhibitor和Oligod(T)18Primers购自宝生物工程(大连)有限公司；TaqDNA聚合酶和dNTPs购自天根生化科技(北京)有限公司；SanPrep柱式DNA胶回收试剂盒、SanPrep柱式PCR产物纯化试剂盒和SanPrep柱式质粒小量抽提试剂盒购自生工生物工程(上海)股份有限公司；2XTaqMast
