耐热菌的竞争定量pcr检测方法优化与建立

耐热菌的竞争定量pcr检测方法优化与建立

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1、中国农业科学2006,39(2):375-380ScientiaAgriculturaSinica耐热菌的竞争定量PCR检测方法优化与建立121李建科,冯再平,仇农学12(陕西师范大学食品工程系,西安710062;兰州理工大学生命科学与工程学院,兰州730050)摘要:【目的】研究苹果浓缩汁中耐热菌(Alicyclobacillusacidoterrestris)的定量PCR快速检测法。【方法】通过引物设计、PCR扩增及凝胶纯化试剂盒回收,构建并获得耐热菌的PCR竞争模板;用获得的竞争模板作为定量内标物建立耐热菌的竞争定量PCR(QC-PC

2、R)检测体系。【结果】经对建立的QC-PCR检测体系优化,目标4模板检测灵敏度由5×10个分子/PCR体系,提高到50个分子/PCR体系,竞争模板和目标模板分子共扩增可检测23到5×10个目标模板分子/PCR体系,并能从人工回添苹果浓缩汁样品中定量检测到5×10cfu/PCR体系的耐热菌,整个检测时间为4~5h,比传统的细菌培养皿培养记数法时间(4~5d)大大缩短。【结论】本研究建立的耐热菌竞争定量PCR检测法特异、快速,可作为微生物PCR竞争模板构建和建立竞争定量PCR的方法学参考,也可用于商品果汁和苹果浓缩汁工业化生产中耐热菌的快速检测

3、和质量安全控制。关键词:耐热菌;苹果浓缩汁;竞争定量PCROptimizationandEstablishmentofQuantitativelyCompetitivePCRSystemfortheDetectionofAlicyclobacillusacidoterrestris121LIJian-ke,FENGZai-ping,QIUNong-xue(12DepartmentofFoodEngineering,ShaanxiNormalUniversity,Xi’an710062;CollegeofLifeScienceandEngin

4、eering,LanzhouUniversityofTechnology,Lanzhou730050)Abstract:【Objective】TostudythedetectivemethodofAlicyclobacillusacidoterrestrisinapplejuiceconcentrate(AJC)byquantitativelycompetitivepolymerasechainreaction(QC-PCR)system.【Method】TheQC-PCRsystemfordetectionofAlicyclobacill

5、usacidoterrestriswasestablishedthroughtheprimerdesign,PCRamplification,andreclaimofgelpurificationreagentboxtoconstructandobtainthecompetitivetemplatewhichwasusedasquantitativeinternalstandards.【Result】TheQC-PCR4systemwasoptimizedandestablishedinthisstudy,andthedetectivese

6、nsitivityofthetargettemplatehadgottenbetterfrom5×10to250molecules/PCRsystem.Asaresultofthis,5×10targettemplatemolecules/PCRsystemwasdetectedwhenthetwotemplates3co-amplified,and5×10cfu/PCRsystemofAlicyclobacillusacidoterrestrisinAJCwasdetected.Thedetectivetime(4hto5h)isrema

7、rkablyshortenedfromtraditionalmethod(4dor5d)usingplateculturecounting.【Conclusion】Themethodinthisstudyisbetterthanothersinefficiencyandspecificity,whichcanbeareferenceforcompetitivetemplateconstructionofmicrobePCRandconstructivemethodologyofQC-PCR.Ithaspotentialtobeapplied

8、inAJCcommercialproductionprocessfortherapiddetectionofAlicyclobacillusacidoterrestris.Key

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