毕业论文-渤海海洋沉积物放线菌非培养多样性研究x

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1、渤海海洋沉积物放线菌非培养多样性研究渤海海洋沉积物放线菌非培养多样性研究摘要放线菌研究在酶技术、医药工业和环境保护领域有重要的应用价值有广阔的应用前景,研究渤海沉积物中的放线菌非培养多样性，能促进放线菌资源开发，有利于新物种和新产物的发现。利用放线菌特异性引物扩增16SrDNA基因，构建16SrDNA基因克隆文库，对文库中的克隆片段进行RFLP(RestrictionFragmentLengthPolymorphism，限制性片段长度多态性)分析。研究分析表明:B71-2样品的27个克隆子获得了23个OTUs,

2、其中34.8%的克隆序列分布于放线菌门(phylumActinobacteria)放线菌亚纲(Actinobacteridae)和酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)中，并且在这两个亚纲中有62.5%的克隆序列属于放线菌的新分类单元;另外65.2%的克隆序列以极高的自展值在放线菌门内支持形成一个独立的大分支，极有可能代表一个新亚目或更高级分类单元的类群。B37-3样品的31个克隆子获得了24个OTUs，其中37.5%的克隆序列分布于放线菌门(phylumActinobacteria)放线菌亚纲(Acti

3、nobacteridae)和酸微菌亚纲(Acidimicrobidae)中，并且在这两个亚纲中有66.7%的克隆序列属于放线菌的新分类单元;另外62.5%的克隆序列以极高的自展值在放线菌门内支持形成一个独立的大分支，极有可能代表一个新亚目或更高级分类单元的类群。通过分析免培养结果，表明渤海放线菌具有较高的多样性，并蕴藏着多种新分类单元，有进一步研究价值。关键词：免培养方法放线菌多样性渤海海洋沉积物渤海海洋沉积物放线菌非培养多样性研究StudiesonthediversityofunculturedActinom

4、ycetesfromthesedimentofBohaiseaAbstractThestudyofActinomyceteshaspotentialapplicationinthefieldsofmedicalindustry,biologicalchemistryandenvironmentalprotection.StudiesontheactinobacterialdiversityintheYellowseaandBohaiseawouldpromotethedevelopmentandutilizat

5、ionofactinomycetesresources.Specificprimerswereusedtoamplifytheactinobacterial16SrDNAgene,andcorrespondingclonelibrarieswereconstructedforthesedimentsamples.DifferentclonesselectedonthebasisofHaeIIIdigestionpatternsweresequenced.Theanalysisof16SrDNAgeneseque

6、ncesshowedthat:27clonesequencesofB72-1include23OTUs,34.8%ofwhichbelongedtophylumActinobacteria,subclassActinobacteridaeandsubclassAcidimicrobidae.Inthesetwosubclasses,65.2%oftheclonesequencesbelongedtonewtaxonsofActinomycetes.65.2%oftheclonesequenceswithhigh

7、bootstrapvaluesinphylumActinobacteriasupporttheformationofanindependentbranch,mostlikelyrepresentsanewsuborder,ormoreadvancedtaxagroups.31clonesequencesofB37-3include24OTUs,37.5%ofwhichbelongedtophylumActinobacteria,subclassActinobacteridaeandsubclassAcidimi

8、crobidae.Inthesetwosubclasses,65.2%oftheclonesequencesbelongedtonewtaxonsofActinomycetes.62.5%oftheclonesequenceswithhighbootstrapvaluesinphylumActinobacteriasupporttheformationofanindependentbr