南海海洋沉积物放线菌多样性的分析与一株放线菌新种鉴定

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1、南海海洋沉积物放线菌多样性分析及一株放线菌新种的鉴定谨以此论文献给我的导师、家人衷心祝愿我国南海问题早日解决，祖国繁荣昌盛！----------王超南海海洋沉积物放线菌多样性分析及一株放线菌新种的鉴定南海海洋沉积物放线菌多样性分析及一株放线菌新种的鉴定学位论文答辩日期：指导教师签字：答辩委员会成员签字:南海海洋沉积物放线菌多样性分析及一株放线菌新种的鉴定独创声明本人声明所呈交的学位论文是本人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。据我所知，除了文中特别加以标注和致谢的地方外，论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包含未获得或其他教育机

2、构的学位或证书使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示谢意。学位论文作者签名：签字日期：年月日--------------------------------------------------------------------学位论文版权使用授权书本学位论文作者完全了解学校有关保留、使用学位论文的规定，并同意以下事项：1、学校有权保留并向国家有关部门或机构送交论文的复印件和磁盘，允许论文被查阅和借阅。2、学校可以将学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、

3、汇编学位论文。同时授权清华大学―中国学术期刊(光盘版)电子杂志社‖用于出版和编入CNKI《中国知识资源总库》，授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》。（保密的学位论文在解密后适用本授权书）学位论文作者签名：导师签字：签字日期：年月日签字日期：年月日南海海洋沉积物放线菌多样性分析及一株放线菌新种的鉴定南海海洋沉积物放线菌多样性分析及一株放线菌新种的鉴定摘要南海是我国四大海域中最大、最深，自然资源及生物资源最为丰富的海区，同时拥有丰富的放线菌资源，目前对这一特色海洋生态系统中的海洋放线菌种群、数量及多样性值知之甚少，非常有

4、必要对这一海域的放线菌进行多样性研究，这对于后期纯培养菌株的分离、我国药用微生物资源的开拓具有重要意义。选取水深3235m和4242m的两个位点N40-4、N63-4，构建并分析16SrDNA基因克隆文库，进行多样性研究。两个位点均表现出丰富的放线菌多样性，克隆序列在放线菌门的放线菌纲（Actinobacteria）、酸微菌纲（Acidimicrobiia）、腈基降解菌纲（Nitriliruptoria）和嗜热油菌纲（Thermoleophilia）四个纲中均有分布。两个位点之间的种群结构差异较大，N40-4位点的优势种群是腈基降解菌目（Nitril

5、iruptorales）和链霉菌目（Streptomycetales）；N63-4位点的优势种群是腈基降解菌目（Nitriliruptorales）和酸微菌目（Acidimicrobiales）。将不同分类单元代表序列与最大已知同源性序列构建N-J系统发育进化树，发现很多序列形成独立的分支，与已知的同源性最大的菌株序列遗传距离较远，表明南海沉积物拥有独特的放线菌类群，蕴藏大量的新种资源。利用7种不同的培养基对南海18个位点沉积物样品进行放线菌的分离纯化,获得41株放线菌，根据菌株形态初步排重后选取19株进行16SrDNA全长序列测定。测定结果提交到E

6、zBioCloud数据库并进行Blast比对，结果显示19个菌株分别属于10个属12个不同的种，有14株分离自深海样品，分别属于10个属10个不同的种，进一步表明南海深海沉积物放线菌多样性极为丰富。菌株OAct400与已知模式菌株最大序列同源性为97.73%，可基本确定为一个潜在的新种；菌株OAct415与已知菌株最大同源性为98.96%，可能是一个潜在的新亚种，具体分类学位置还需结合其他生理生化指标和化学鉴定指标才能确定。将所有菌株序列与最大同源性序列构建N-J系统发育进化树，发现发育树结构复杂，分支较多，链霉菌属（Strrptomyces）在发育

7、树中处于一个小的独立分支，表明南海海洋沉积物放线菌多样性分析及一株放线菌新种的鉴定链霉菌属并不是优势菌群，南海沉积物放线菌菌群结构与陆地环境不同，多样性丰富，蕴藏大量的新种资源。从水深2093米的N42-5样品中分离的菌株OAct400，革兰氏阳性，菌落呈脏白色，无气生菌丝，细胞呈杆状，无孢子结构。根据16SrDNA序列同源性比对，菌株OAct400与微杆菌属（Microbacterium）不同菌种的序列相似度在T94%-97.73%之间，相似度最高的是MicrobacteriumamylolyticumN5（97.73%）、TMicrobacter

8、iumgubbeenenseLMG19263（97.44%）和Microbacteriumgubbeenen