fat10基因遗传变异与肝细胞癌发生发展的关联性研究

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1、南昌大学硕士学位论文FAT10基因遗传变异与肝细胞癌发生发展的关联性研究姓名：袁荣发申请学位级别：硕士专业：外科学指导教师：邵江华201205摘要，目的：研究FATl0基因外显子和侧翼序列单核苷酸多态性(single-nucleotidepolymo印hism，SNP)与肝细胞癌发生和临床病理的关系。方法：收集254例肝癌病例和268例健康对照人群外周血标本，提取DNA，通过DNA直接测序分析方法，检测两组人群F．ATl0基因外显子和侧翼序列单核苷酸多态性。应用Haploview统计软件分析研究对象的连锁不平衡和单体型，并应用病例对照分析方法进行相关

2、性研究。结果：在病例组和对照组共检测到lO个SNPs。依据测序数据和遗传不平衡分析选择3个tagSNPs(．143A／G、+3476T／C和+3527T／C)进行关联分析和单体型构建，发现．143A／G和+3476T／C基因型与相应的野生型纯合子相比明显降低肝癌的发病风险(OR=O．38，95％CI：0．22．O．66和OR=O．34，95％CI：0．21．O．56，p<0．05)，但这些多态性位点的基因型频率与肝癌的临床表型无关(p>0．05)。另外单体型分析发现ATT、ATC、GCT和ACT四种单体型，其中肝癌组GCT和ACT单体型频率显著低于对

3、照组(OR=0．4l，95％CI=0．24．0．70和OR=O．43，95％CI=O．22．0．98，p<0．05)，而ATT单体型频率显著高于对照组(OR=1．64，95％CI=1．24．2．17，p<0．05)，经过l×108的随机置换检验校正后，ATT和GCT单体型与肝癌的发病风险仍然显著相关(p

4、lO基因；单核苷酸多态性；单体型；肝细胞癌；病例对照研究AbstractABSTRACTobjectiVes：Thisstudyex帅inedwhethersinglenucleotidepolymorphisminexonicandflankingsequenceofthehumanHLA—Fadjacenttranscriptl0(FAT1O)genewereassociatedwithsusceptibiIityandclinicopathoIogicaldeVelopmentofhapatocellularcarcinoma(HCC)．Met

5、hods：Atotalof522suboects，including268healthycontrolsand254patientswithHCC，wererecruited．GenotypingwasdonebyusingDNAsequencing．HaplotypesandLinkagedisequ．1ibriumanalysiswereestimatedbyhaploViewsoRware．Theoddsratios(ORs)and95％con矗denceintervals(CIs)werecalcuIatedusingunconditiona

6、llogisticregressionmodeltoestimatethecorrelationsoftheFATl0geneticVariationtodeVelopmentofhepatoceIlularcarcinoma．I沁sults：T色nSNPsinFATl0wereidentif．edinbothHCCpatientsandcontrolsubjects．The—143A／G+3476T／C，+3527T／CtagSNPsthatwereselectedforassociationandhaplotypeanalysiswerechos

7、enbasedonthedataofDNAsequencingandlinkagedisequilibriumanalysis．The一143A／G+3476’r／CgenotypeswereassociatedwithadecreasedriskforHCC(OR=0．38，95％CI：0．22-0．66andOR=O．34，95％CI：0．2l-O．56，p0．05)．Furthernlore，atotalo

8、f4haplotypeswerefound，nameIyATT，ATC，GCT，ACT．thef-reque