我国不同地域烟曲霉临床分离株基因型分析

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时间:2019-02-02

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1、目录英汉缩略词表……………………………………………………1论文摘要中文摘要……………………………………………………3英文摘要……………………………………………………5论文正文前言……………………………………………………8材料和方法………………………………………………11结果……………………………………………………24讨论…………………………………………………35结论……………………………………………………43参考文献…………………………………………………44致谢………………………………………………………47文献综述综述…………………………………………………48参考文献………

2、…………………………………………53附录:攻读硕士学位期间发表论文及著作英汉缩略词名称对照英文缩写英文全称中文全称CSPCellsurfaceprotein细胞表面蛋白STRShorttandemrepeats短串联重复序列MLSTMulpitlelocussequence多位点序列分型typingITSInternaltranscribedspacer内转录区间PCRPolymerasechainreaction聚合酶链式反应RAPDRandomamplified随机扩增多态性DNApolymorphicDNA标记RFLPRestrictionfragment限制性内切酶

3、片段长lengthpolymorphism度多态性AFLPAmplifiedfragmentlength扩增片段长度多态性polymorphismPDAPotatodextroseagar马铃薯葡萄糖琼脂培养基EDTAEthylenediamine乙二胺四乙酸tetraaceticacidPAGEPolyacrylamidegel聚丙烯酰胺凝胶电泳electrophoresisSDSSodiumdodecylsulfate十二烷基磺酸钠TrisTris(hydroxymethyl)三羟甲基氨基甲烷NCBINationalcenterfor美国国家生物信息中biotechno

4、logyInformation心BLASTBasiclocalalignment基因序列比对搜索工searchtool具DNADeoxyribonucleicAcid脱氧核糖核酸dNTPDeoxy-ribonucleoside三磷酸脱氧核糖核苷triphosphate1BpBasepair碱基对rmpRevolutuinsperminute每分钟转速ODOpticaldensity光密度EP管Eppendorfpipe离心管TBETris/borate硼酸电泳缓冲液eletrophoresisbufferddH2ODoubledistilledwater双蒸水NaAcEth

5、anolanhydrous无水乙醇NCCLSNationalcommitteefor美国临床实验室标准clinicallaboratory化委员会standardsDMSODimethylsulfoxide二甲基亚砜RPMIRoswellparkmemorial细胞培养基instituteMICMinimalinhibitory最低抑菌浓度concentrationIAInvasiveaspergillosis侵袭性曲霉病HEPAHighefficiency高效微粒空气过滤器particulateairfilterA.fumigatusAspergillusfumigatu

6、s烟曲霉A.flavusAspergillusflavus黄曲霉A.nigerAspergillusniger黑曲霉A.terreusAspergillusterreus土曲霉A.lentulusAspergilluslentulus仑图卢斯曲霉2摘要背景:近年来,随着院内严重免疫缺陷患者数量的增加,侵袭性曲霉病已成为血液病房、器官移植中心及重症监护病房患者死亡的主要原因,曲霉已成为仅次于念珠菌的一个重要的致病菌。而在致病曲霉中烟曲霉(A.fumigatus)是最主要的致病菌。由于不同国家和地区存在不同的优势致病菌株,采用分子系统学的方法对各个地区的致病烟曲霉进行研究有助于

7、确定致病株流行特征与曲霉种群的关系。目的:1)以我国北京、上海、福建及河北临床分离到的烟曲霉为研究对象,分别通过形态学、镜下特点、温度试验及β-tubulin分子生物学方法鉴定后,再对烟曲霉进行CSP基因分型,从而了解我国不同地域致病烟曲霉临床分离株分布情况。2)检测临床分离到的烟曲霉对不同抗真菌药物的体外敏感性,为临床治疗和采取预防措施提供有意义的线索和指导,并比较不同基因型之间及不同地区之间的烟曲霉的体外抗真菌药物敏感性是否有差异。方法:本研究对我国北京、上海、福建及河北收集到的112株烟曲霉临床分离株分别进行

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