花金龟科(cetoniidae)部分种类基因序列及系统发育关系研究

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1、沈阳大学硕士学位论文本试验研究中使用核酸测序法测定了花金龟科43条核酸序列,分别为:褐绣花金龟(AnthracophorarusticolaBurmeister)、白星花金龟(ProtaetiabrevitarsisLewis)、多纹星花金龟(ProtaetiafamelicaJanson)蓝星花金龟(ProtaetiaimpavidaJanson)的Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA、COII基因序列,华美花金龟(CetoniamagnificaBallion)、暗绿花金龟(Cetoniaviridiop

2、acaMotschulsky)、黄粉鹿花金龟(DicranocephaluswallichibowringiPascoe)的Cytb、COI、28SrRNA、COII基因序列,疏纹星花金龟(ProtaetiacathaicaBates)的Cytb、COI、28SrRNA基因序列,双斑短突花金龟(GlycuphananicobaricaJanson)Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA基因序列,小青花金龟(OxycetoniajucundaFaldermarm)Cytb、16SrRNA、28SrRNA基因序列,

3、自NCBI中查询下载一条Chilolobaacuta的28SrRNA基因序列。应用DNAmanl00软件及ClustalX2.0软件进行拼接、校正及多重同源性比较,MEGA4.0软件对序列组成和遗传距离进行分析,并采用Kimura.2参数模型、NJ法和MP法重建系统发育树。得到下述结论:(1)花金龟科11个种Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA、COII基因序列长度分别为350bp、537bp、703bp、600bp、246bp,保守位点分别为226个、372个、572个、577个、156个,其中均为第二位点

4、居高;变异位点依次为124个、165个、131个、23个、90个,第三位点的变异率最高。Cytb基因序列中A、T、G、C的平均含量分别为36.8%、33.2%、19%、11%,其中A_卜T的平均含量为70.O%,G+C的平均含量为30.0%;COI基因序列中A、T、G、C的平均含量分别为30.3%、35.5%、15.9%、18.2%,其中A+T的平均含量为75.8%,G+C的平均含量为34.2%;16SrRNA基因序列中A、T、G、C的平均含量分别为39.9%、34.1%、8.7%、17.2%,其中A+T的平均含量为74

5、%,G+C的平均含量为25.9%;COII基因序列中A、T、G、C的平均含量分别为34.2%、32.8%、17.8%、15.2%,其中A+T的平均含量为67%,G+C的平均含量为33%。28SrRNA基因序列中A、T、G、C的平均含量分别为25.4%、20.8%、沈阳大学硕士学位论文30.4%、23.4%,其中A+T的平均含量为46.2%,G屺的平均含量为53.7%。表现出明显的线粒体及核的碱基偏好性。(2)花金龟科11个种Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA、COII的碱基转换/颠换平均值(It值)分别为1

6、.1、1.2、1.3、2.5、1.1。其中,Cytb基因序列的疏纹星花金龟与多纹星花金龟的R值为2.3745,16SrRNA基因的白星花金龟与多纹星花金龟R值为2.5179,COII基因的蓝星花金龟与多纹星花金龟R值为1.5731,均说明属内不同种间的R较大,亲缘关系较近,这与形态学分类结果基本相吻合。(3)花金龟科11个种Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA、COII基因的遗传距离分别为0.0097.0.4103、0.0038.0.2340、0.0104.0.1571、0.0104.0.0223、0.009

7、7.0.2477。其中最小值均发生在星花金龟属内,尤以疏纹星花金龟、白星花金龟之间与多纹星花金龟之间最小,说明同属不同种亲缘关系较近。(4)线粒体Cytb、COI、16SrRNA、COII基因序列中,氨基酸使用中频率最高的是Leu(亮氨酸),密码子使用频率最高的为UAA、AAA;核基因序列氨基酸使用频率最高的是Arg(精氨酸),密码子使用频率最高的是CUC。说明线粒体基因与核基因在氨基酸和密码子的使用方面有明显差异。(5)基于Cytb、COI、16SrRNA、28SrRNA、COIl5种基因,采用Kimura-2参数模型

8、分别构建的11种花金龟NJ树和MP树结果显示:NJ和MP树的系统发育关系基本一致,即星花金龟属Protaetia的疏纹星花金龟、白星花金龟、多纹星花金龟、蓝星花金龟优先聚为一个分支,其次为花金龟属Cetonia的华美花金龟(长毛花金龟)和暗绿花金龟,其他属先后聚集在花金龟科支下,外群多色异丽金龟和斑股锹甲处于次外枝和

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