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1、恩蚜小蜂属部分种类28SrDNA及CO1基因序列的分子进化和系统学研究专业：生物化学与分子生物学姓名：邢建晓学号：20141155摘要本文通过对恩蚜小蜂属部分种类28SrDNA及CO1序列进行分析，重建恩蚜小蜂属的部分种类系统发育关系。使用ClustalX1.81对来源于Genbank上的27种恩蚜小蜂属28SrDNA及CO1序列片段进行了同源性比较，并利用MEGA5.0软件计算碱基含量、颠换值、转换值、颠换比和遗传距离，采取相邻连接法、最小进化法、最大似然法构建了恩蚜小蜂属的系统发育树。结果显示，恩蚜小蜂属28SrDNA序
2、列的保守位点为3,占总位点数的0.55%;序列变异位点为538,简约信息位点为536,占序列总位点的99.1%，转换数为113,颠换数为237,碱基的转换主要发生在TC间,转换的频率是颠换频率的0.48倍,由此可以认为恩蚜小蜂属的28SrDNA的保守性较强。恩蚜小蜂属C0I序列的保守位点为1,占总位点数的0.15%;序列变异位点为680,占总变异位点的99.7%;简约信息位点为678。其中转换数为99,颠换数为284,可见恩蚜小蜂属的C0I序列的变异率较高。关键词：恩蚜小蜂属28SrDNA系统发育AbstractThisar
3、ticleanalysis28SrDNAandCO1sequenceofEncarsia,andreconstructthegenuspartofphylogeneticrelationshipsofEncarsia.UsingClustalX1.81fromof27EncarsiainGenbankcompared28srDNAandCO1sequencefragments.ThehomologyandMEGA5.0softwareisusedtocalculatebasecontent,transversionvalue
4、,transformation,transversionratioandgeneticdistance.Takingtheadjacentconnectionmethod,minimumevolutionmethod,maximumlikelihoodmethodtoconstructthephylogenetictreesoftheEncarsia.AccordingtotheresultsofEncarsia,conservativesitesof28ssequencesis3,accountingfor0.55%oft
5、hetotalnumbers;Sequencemutationlociis538,contractedandinformationsiteis536,accountingfor99.1%ofthesequenceoftotal,convertthenumberis113,Britainis237,thebasesofthetransformationoccurbetweenmainlyinTC,thefrequencyoftransformationisatransversionof0.48times,whichcanbet
6、houghtofEncarsiaofthe28sconservativeisstronger.TheEncarsiaofC0Isequenceofconservativesitesis1,accountingfor0.15%ofthetotalnumbers;Sequencemutationsitesis680,accountingfor99.7%ofthetotalvariationsites.Asimpleinformationsiteis678whichconvertthenumberto99.Britainis284
7、,EncarsiagenusC0Isequencevariationrateishigher.Keywords:Encarsia28SrDNAsystemdevelopment目录1前言-1-1.1恩蚜小蜂属分类地位-1-1.2序列比对-2-1.3系统发育树的构建方法-2-1.4本论文研究目的与意义-3-2步骤与方法-3-2.1序列比对-3-2.2计算遗传距离-4-2.3序列特征分析-4-2.4系统发育树的构建-4-3结果与分析-5-3.128SrDNA序列的分析-5-3.1.128SrDNA序列核苷酸的组成-5-3.1.2
8、28SrDNA序列的碱基替换情况分析-6-3.2COI序列的分析-7-3.2.1COI序列核苦酸的组成-7-3.2.2COI序列的碱基替换情况分析-7-3.3恩蚜小蜂属的系统发育分析-8-3.3.1用最大似然法(ML)建树-8-3.3.2用相邻连接方法(NJ)建树-10-3.3.3用最小进
