家蚕一新基因bmpseg原核表达及亚细胞定位

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1、浙江理工大学硕士学位论文摘要在对自建的家蚕蛹期eDNA文库测序中,我们筛选到一条eDNA序列,GenBank登录号DY231426,通过生物信息学分析,该基因同源性很低,而且也没有发现保守结构域。该基因长度为661bp,其中5'UTR长99bp,3'UTR长76bp,ORF长486bp,编码161个氨基酸残基,蛋白分子量为18.61kD,理论等电点为9.461。Unigene分析预测该基因只在蛹期表达,因此,将其命名为pupa-sepeeifieexpresstiongene(Bmpseg)。利用生物信息学分析方法预测该基因的蛋白

2、存在跨膜区和信号肽。通过PCR把Bmpseg的ORF扩增后插入到载体PGEX-4T.3的BamHI和XhoI位点,获得重组表达质粒pGEX-4T-3.Bmpseg,转化大肠杆菌Rosetta,经PCR、酶切鉴定以及测序分析证实重组正确。IPTG诱导后裂解菌作SDS.PAGE分析,在44.6kD处有一浓集特异性蛋白条带,与预期值相符。融合蛋白以不溶性的包涵体的形式存在,超声波裂解菌体分离包涵体并离心、洗涤;对包涵体进行溶解和梯度透析复性;采用亲和层析法纯化融合蛋白Bmpseg。以该融合蛋白为抗原免疫新西兰大白兔,制备了Brnpseg

3、多克隆抗体,经ProteinAHP凝胶柱纯化后,ELISA检测该抗体的效价可达到1:12800。免疫印迹检测显示该抗体对Bmpseg有特异性识别能力。提取五龄蚕脂肪体、马氏管、气管、睾丸、肠、头、丝腺、表皮等不同组织总蛋白和不同发育时期总蛋白,做免疫印迹试验,结果表明该蛋白只在蛹期表达,推测该基因可能是蛹期特异性表达基因。亚细胞定位表明蛋白定位在细胞质。关键词家蚕Bmpseg基因包涵体纯化亚细胞定位浙江理工大学硕士学位论文ExpressionandsubcellularlocalizationofanewgeneBmpsegfro

4、msilkworm,BombyxmoriAbstractAccordingtothelarge—scaleeDNAsequencingofsilkwormpupgauniqueunknownBombyxmoileDNAwasidentifiedafterBlastbasedonNCBIdatabase,itsgenebankaccessionnumberisDY231426.Theproteinsequenceofthisgeneshareslowhomologouswithothergenes’inNCBI,furthermor

5、e,thisproteinhasnoconverseddomains.Thefulllengthofthegeneis661bpwhichcontains5q3TR(99bp),ORF(486bp)and3qdTR(76bp).TheORFencodes161aminoacids谢mthepredictedmolecularweightof18.6kDandisoelectriepoiIltof9.46.Unigeneanalysispredictthatthisgeneisonlyexpressedinpupastage,SOi

6、tWasnamedaspupa-sepecificexpresstiongene(Bmpseg)。TheproteinsequenceofBmpsegWasanalysedbywebsiteofHydrophobicityanalysis,transmemberanalysisandsignalpeptideanalysis,theresultsindicatethattheBmpsegproteinmayhastransmemberre西onandsi粤1a1peptide.Twoprimersweredesignedtoobt

7、ainthecodingregionofBmpseggenefromsilkwormpupaESTdatabase.TheORFofthegeneWasclonedintopGEX-4T-3vectorwithBamHIandXhoIdigestion.TherecombinantplasmidWastransformedintoE.coliRosetta.PCRanddigestionwithBamHI/XhoIshowedthatthedesignedfragmentWasinsertedcorrectly.Therecomb

8、inantplasmidWassequencedandthesequencemapindicatedthatarecombinantexpressionplasmidwasconstructedsuccessfully.Recombinantpro

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