非小细胞肺癌中ptb对肿瘤抑制基因ceacam1选择性拼接的调控研究_1

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1、从本学科出发,应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性,便于研究生提出新见解,特别是博士生必须有创新性的成果非小细胞肺癌中PTB对肿瘤抑制基因ceacam1选择性拼接的调控研究[摘要]目的:研究在非小细胞肺癌及癌旁组织中ceacam1通过选择性拼接而产生的两种转录产物的调控机制。方法:将用PCR方法获得ceacam1基因中从内含子5至外显子8长10bpDNA片段插入到真核表达载体pCMV中,构建成ceacam1迷你基因模型并与ptb基因共转染,用PCR法鉴定转染后的产物变化;根据外显子7序列设计的探针GAE及ACE进行凝胶阻滞分析实验。分离与探针结合的蛋白并

2、进行质谱分析。结果:ptb种cDNA与ceacam1迷你基因共转染后,CEACAMlL表达水平下降,其中ptb对迷你基因的表达产物影响最大。仅转染迷你基因的细胞中ceacam1L在两条带中所占比例为%,而与ptb种重组质粒共转染后,比例分别下降至%、%和%。凝胶阻滞实验表明,探针GAE能与核蛋白结合,而ACE基本不能与核蛋白结合,与GAE结合的蛋白经质谱分析为PTB。结论:PTB过表达与ceacam1低表达有明显的相关性,拼接因子PTB参与ceacam1的选择性拼接。[关键词]迷你基因;选择性拼接;癌胚抗原相关的细胞粘附分子1;拼接因子PTB;凝胶阻滞分析;非小细胞肺癌课题份量和难易

3、程度要恰当,博士生能在二年内作出结果,硕士生能在一年内作出结果,特别是对实验条件等要有恰当的估计。从本学科出发,应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性,便于研究生提出新见解,特别是博士生必须有创新性的成果癌胚抗原相关的细胞粘附分子1(CEACAM1或CCAM1),在多种上皮细胞起源的肿瘤中起肿瘤抑制基因作用,属于免疫超家族基因[1]。该基因长约,共有9个外显子组成,其中第七外显子长5bp,位于CEACAM1的胞内端,可通过选择性拼接去除,从而产生CEACAM1L和CEACAM1S两种转录产物。CEACAM1L含外显子7,因此胞内端较长,而在CEACAM1S

4、的形成中,由于外显子7被剪切,其胞内端少了73个氨基酸[2]。有研究表明,CEACAM1在多种肿瘤如肠癌、肝癌、乳腺癌和前列腺癌中的表达水平普遍下降[34]。当鼠的CEACAM1L被转入鼠的肠癌或乳腺等细胞时,细胞的生长速度明显减慢,恶性程度降低[57]。Estrera等[8]研究认为,仅表达CEACAM1L的胞内部分即能产生抑制肿瘤生长的作用,因此CEACAM1L的胞内端对抑制肿瘤的生长是必需的。在肺癌中,RNA原位杂交和Northernblot分析结果表明,CEACAM1L在75%的肺癌旁组织高表达,而CEACAM1S在84%的肺癌组织中高表达[9]。根据此现象,我们推测CEAC

5、AM1第7外显子的选择性拼接与某种拼接因子有关,CEACAM1两种拼接产物的表达谱受到该因子的调控。为了验证此假设,我们采用了迷你基因模型及凝胶迁移等实验表明了ceacam1的第7外显子序列能与拼接因子PTB(polypyrimidinetractbindingprotEin,hnRNPⅠ)特异结合,CEACAM1L和CEACAM1S的表达比例与拼接因子PTB的表达水平相关。1材料和方法课题份量和难易程度要恰当,博士生能在二年内作出结果,硕士生能在一年内作出结果,特别是对实验条件等要有恰当的估计。从本学科出发,应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性,便于研

6、究生提出新见解,特别是博士生必须有创新性的成果菌株、质粒及试剂大肠杆菌DH5α由作者所在实验室保存。限制性内切酶、T4DNA连接酶购自TaKaRa公司,CompleteTMproteaseinhibitorcocktail购自Roche公司,BCA蛋白定量试剂盒购自Pierce公司,LipofectAMINETM和RNAzol试剂购自Invitrogen公司,NonidetP40(NP40)购自Sigma公司。1.2方法细胞培养人非小细胞肺癌H157、H1944细胞株由美国安得森癌症中心毛力先生惠赠。细胞在37℃、5%CO2、DMEM/F12培养基中生长。ceacam1迷你基因及pt

7、bpCDNA重组质粒的构建从H157细胞株提取RNA,以随机引物为模板逆转录成cDNA,用RTPCR方法获得ceacam1基因中从内含子5至外显子8长10bpDNA片段,经酶切后插入到真核表达载体pCMV中,重组质粒经测序鉴定。引物序列为:5′GGGGTACCATGACAAATAATGCTCTACC3′和5′AAAAGCTTGTTAGGTGGGTCATTGG3′。为了避免内含子5和外显子6的连接处拼接位点对拼接可能的影响,我们将内含子5拼接位点内的“ag”

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