非小细胞肺癌中ptb对肿瘤抑制基因ceacam1选择性拼接的调控研究论文

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1、非小细胞肺癌中PTB对肿瘤抑制基因ceacam1选择性拼接的调控研究论文摘要目的:研究在非小细胞肺癌及癌旁组织中ceacam1通过选择性拼接而产生的两种转录产物的调控机制。方法:将用PCR方法获得ceacam1基因中从内含子5至外显子8长1606bpDNA片段插入到真核表达载体pCMV中,构建成ceacam1迷你基因模型并与ptb基因共转染,用PCR法鉴定转染后的产物变化;根据外显子7序列设计的探针GAE(16nt)及ACE(8nt)进行凝胶阻滞分析实验。分离与探针结合的蛋白并进行质谱分析。结果:ptb3种cDNA与ceacam

2、1迷你基因共转染后,CEACAMlL表达水平下降,其中ptb4对迷你基因的表达产物影响最大。仅转染迷你基因的细胞中ceacam1L在两条带中所占比例为76.7%,而与ptb3种重组质粒共转染后,比例分别下降至58.3%、64.8%和54.0%。凝胶阻滞实验表明,探针GAE能与核蛋白结合.freel1低表达有明显的相关性,拼接因子PTB参与ceacam1的选择性拼接。关键词迷你基因;选择性拼接;癌胚抗原相关的细胞粘附分子1;拼接因子PTB;凝胶阻滞分析;非小细胞肺癌癌胚抗原相关的细胞粘附分子1(CEACAM1或CCAM1),在多种

3、上皮细胞起源的肿瘤中起肿瘤抑制基因作用,属于免疫超家族基因1。该基因长约1.48kb,共有9个外显子组成,其中第七外显子长53bp,位于CEACAM1的胞内端,可通过选择性拼接去除,从而产生CEACAM1L和CEACAM1S两种转录产物。CEACAM1L含外显子7,因此胞内端较长,而在CEACAM1S的形成中,由于外显子7被剪切,其胞内端少了73个氨基酸2。有研究表明,CEACAM1在多种肿瘤如肠癌、肝癌、乳腺癌和前列腺癌中的表达水平普遍下降34。当鼠的CEACAM1L被转入鼠的肠癌或乳腺等细胞时,细胞的生长速度明显减慢,恶性程

4、度降低57。Estrera等8研究认为,仅表达CEACAM1L的胞内部分即能产生抑制肿瘤生长的作用,因此CEACAM1L的胞内端对抑制肿瘤的生长是必需的。在肺癌中,RNA原位杂交和Northernblot分析结果表明,CEACAM1L在75%的肺癌旁组织高表达,而CEACAM1S在84%的肺癌组织中高表达9。根据此现象,我们推测CEACAM1第7外显子的选择性拼接与某种拼接因子有关,CEACAM1两种拼接产物的表达谱受到该因子的调控。为了验证此假设,我们采用了迷你基因模型及凝胶迁移等实验表明了ceacam1的第7外显子序列能与拼

5、接因子PTB(polypyrimidinetractbindingprotein,hnRNPⅠ)特异结合,CEACAM1L和CEACAM1S的表达比例与拼接因子PTB的表达水平相关。1材料和方法1.1菌株、质粒及试剂大肠杆菌DH5α由作者所在实验室保存。限制性内切酶、T4DNA连接酶购自TaKaRa公司,pleteTMproteaseinhibitorcocktail购自Roche公司,BCA蛋白定量试剂盒购自Pierce公司,LipofectAMIM和RNAzol试剂购自Invitrogen公司,NonidetP40(NP40

6、)购自Sigma公司。1.2方法1.2.1细胞培养人非小细胞肺癌H157、H1944细胞株由美国M.D.安得森癌症中心毛力先生惠赠。细胞在37℃、5%CO2、DMEM/F12培养基(含5%的小牛血清、100Uml-1青霉素和100μgml-1链霉素)中生长。1.2.2ceacam1迷你基因及ptbpCDNA重组质粒的构建从H157细胞株提取RNA,以随机引物为模板逆转录成cDNA,用RTPCR方法获得ceacam1基因中从内含子5至外显子8长1606bpDNA片段,经酶切后插入到真核表达载体pCMV中,重组质粒经测序鉴定。引物序

7、列为:5′GGGGTACCATGACAAATAATGCTCTACC3′和5′AAAAGCTTGTTAGGTGGGTCATTGG3′。为了避免内含子5和外显子6的连接处拼接位点对拼接可能的影响,我们将内含子5拼接位点内的“ag”突变为“aa”。PTB1、PTB2和PTB43种pCDNAPTB表达载体由冷泉港实验室DavidHelfman惠赠。1.2.3ceacam1迷你基因与ptbpCDNA共转染选用H1944细胞株作为ceacam1迷你基因及ptbpCDNA共转染的宿主细胞,实验按LipofectAMIM转染试剂盒操作说明书进行

8、。细胞在100mm培养皿中长至约80%,加入DNA/lipofectAMIM混合物10μg(40μl)-1,室温放置40min和4ml无血清、无抗生素的培养基混合物,37℃培养6h后,更换为含有血清和抗生素的培养基。转染72h后收集细胞,用RNAzol提取总RN

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