三种沼虾的coi基因序列变异及其分类地位探讨

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1、从本学科出发，应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性，便于研究生提出新见解，特别是博士生必须有创新性的成果三种沼虾的COI基因序列变异及其分类地位探讨动物学研究00930(6):613-619ISSN:0254-5853CN:三种沼虾的COI基因序列变异及其分类地位探讨张凊漪1，程起群2,*，管卫兵11.上海市教委大洋生物资源开发和利用重点实验室，上海海洋大学海洋科学学院，上海01306；2.农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室，中国水产科学研究院东海水产研究所，上海00090收稿日期009-5-1修回日期网络版发布日期009-

2、12-20接受日期009-10-摘要罗氏沼虾(Macrobrachiumrosenbergii)和日本沼虾(M.课题份量和难易程度要恰当，博士生能在二年内作出结果，硕士生能在一年内作出结果，特别是对实验条件等要有恰当的估计。从本学科出发，应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性，便于研究生提出新见解，特别是博士生必须有创新性的成果nipponense)已经在我国得到广泛的养殖，产生巨大的经济效益。祁连沼虾是自然分布在我国甘肃省的土著虾种，因其外部形态符合沼虾属的特征，而被前人归入沼虾属。为了从分子生物学的角度理解罗氏沼虾、日本沼虾与祁连沼

3、虾的遗传差异，为合理开发和利用沼虾资源提供理论基础，作者对这3种沼虾的线粒体COI基因序列进行研究。从甘肃、浙江等地分别采集这三种沼虾的样本各10尾，共30尾，其中祁连沼虾是野生样本，而罗氏沼虾和日本沼虾都是养殖样本。通过PCR方法扩增线粒体COI基因，并测序。通过比对，获得一致序列64bp。在30个样本中共检测到169个变异位点，占总变异的%；共检测到7种单倍型。种沼虾的核苷酸多态性分别为：罗氏沼虾%、日本沼虾%、祁连沼虾%。野生的祁连沼虾遗传多样性远远低于养殖的罗氏沼虾和日本沼虾。三种沼虾单倍型之间的Kimura双参数遗传距离在%~%，三者之间的遗传距离较大，

4、提示三者均为有效种。为进一步确定这三种沼虾在长臂虾科的分类地位，我们从NCBI数据库中下载了长臂虾科的其它种类的COI序列进行系统发生分析。用NJ法构建的分子系统树显示：日本沼虾和罗氏沼虾与沼虾属的其它种类聚成一枝，而祁连沼虾与同亚科的脊尾白虾和长角长臂虾较沼虾属另10种虾的遗传距离近，即祁连沼虾与白虾属及长臂虾属聚成另一枝。因此，COI序列的结果不支持祁连沼虾归入沼虾属。但其分类地位应该综合多方面证据重新进行分析确定。关键词FONT-FAMILY:'TimesNewRoman'mso-font-kerning:mso-ansi-language:EN-USmso

5、-fareast-language:ZH-CNmso-bidi-language:AR-SA沼虾；遗传差异；分类；COI基因；线粒体DNA')">mso-fareast-font-family:宋体">沼虾；遗传差异；分类；COI基因；线粒体DNA分类号DOI:/本文由中国-通讯作者:程起群qiquncheng@作者个人主页:张凊漪1;程起群2;*;管卫兵1课题份量和难易程度要恰当，博士生能在二年内作出结果，硕士生能在一年内作出结果，特别是对实验条件等要有恰当的估计。从本学科出发，应着重选对国民经济具有一定实用价值和理论意义的课题。课题具有先进性，便于研究生提出新

6、见解，特别是博士生必须有创新性的成果课题份量和难易程度要恰当，博士生能在二年内作出结果，硕士生能在一年内作出结果，特别是对实验条件等要有恰当的估计。