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时间:2018-12-26
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1、为了适应公司新战略的发展,保障停车场安保新项目的正常、顺利开展,特制定安保从业人员的业务技能及个人素质的培训计划外显子测序项目报告(共3篇) 关于开展DNA测序试验的报告分析 伴随着科学技术的发展,对生命科学研究的深入,对各种DNA序列的分析已经成为现代科研的主题,它是生命科学研究中不可或缺的地研究手段,世界前沿科学研究无一不是建立在DNA分析上的。同时,测序服务经过长期的商业化运作,已经发展成熟,有成熟的经验与成果可以借鉴。因此,建立一个属于医院自己的测序中心,不仅仅使满足我院日益曾张的科研需求,也是将医院建设
2、成为一个国际科研型综合医院的必要前提。现将国内测序发展情况作一概括。一、国内知名测序公司: 1、北京三博远志测序公司,公司拥有国际最先进、最权威、精准的新一代DNA测序平台—ABI3730XL多台,度序可达900bp,美国Biolytic公司生产的BLP—192板式高通量合成仪多台,主要经营项目:DNA合成、DNA测序,全基因合成、基因克隆、基因组测序、shRNA质粒构建、菌种鉴定、遗传标记分析、HLA分型、突变检测、甲基化服务等。 DNA测序服务价格(参考)目的-通过该培训员工可对保安行业有初步了解,并感受到安
3、保行业的发展的巨大潜力,可提升其的专业水平,并确保其在这个行业的安全感。为了适应公司新战略的发展,保障停车场安保新项目的正常、顺利开展,特制定安保从业人员的业务技能及个人素质的培训计划 ?3、深圳华大科技,拥有IlluminaHi-Seq、HiseqXX是Illumina公司XX年推出的一款新的测序仪,采用稳定的可逆终止法边合成边测序技术,能够为基因调控分析、转录组分析、SNP位点、结构变异分析和疾病分析等提供迅捷、庞大、准确、ABSoLidSystem,SOLiDTM系统是由AB公司研发的新一代超高通量基因测序分
4、析系统,该系统可以为全转录组、染色质免疫共沉淀和小RNA的发现提供高度敏感的检测方法。IonTorrent,基于半导体芯片的新一代革命性测序技术。 以上三家企业,为国内具有代表性的科研企业, ? 人外显子测序 药明康德基因中心,陆桂 1.什么是外显子测序? 外显子组测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。外显子测序相对于基因组重测序成本较低,对研究基因的SNP、Indel等具有较大的优势,但无法研究基因组结构变异如染色体断裂重组等。 2.外显子捕获试
5、剂盒有哪些? 目前主要有Roche、Illumina和Agilent三家的外显子捕获试剂。Nimblegen和Illumina的捕获试剂盒中的探针是DNA探针,化学性质稳;Agilent的捕获试剂盒是RNA探针,有可能RNA不是很稳定。 3.外显子捕获效率是什么?目的-通过该培训员工可对保安行业有初步了解,并感受到安保行业的发展的巨大潜力,可提升其的专业水平,并确保其在这个行业的安全感。为了适应公司新战略的发展,保障停车场安保新项目的正常、顺利开展,特制定安保从业人员的业务技能及个人素质的培训计划 外显子测序过
6、程中要用到杂交过程。在人的染色体上有许多与外显子有同源性的部分,这些有同源性的部分很可能在杂交过程中也被捕获下来。所以,测到的序列中,有一部分不是外显子序列。我们把测序得是外显子的部分占全部测序序列的比列称为捕获效率。Nimblegen大约是70% Agilent大约是60% Illumina大约是50% 4.外显子测序一般建议做多少倍的覆盖? 一般做100X或者150X。较高的覆盖倍数,对于测异质性的遗传变质,可以发现小比例的突变。另外,外显子测序的覆盖不是很均匀,这样较高的平均覆盖率有利于保证大部分的区域
7、有足够的覆盖倍数。 5.外显子测序能够测出多大的片段缺失? 大致能测出50bp的片段缺失。目前的测序主要还是用HiseqXX,单侧的测长就是100bp。由于外显子测序的覆盖很不平均,所以如果有大段的缺失,无法判断是因为杂交没有捕获到,还是因为缺失。目前能够测到的,就是在一个read中发现的缺失。一个read的长度也就是100bp,所以大到50bp以下的片段缺失可以从外显子测序中测出来。 6.外显子捕获可以做CNV吗?目的-通过该培训员工可对保安行业有初步了解,并感受到安保行业的发展的巨大潜力,可提升其的专业水平
8、,并确保其在这个行业的安全感。为了适应公司新战略的发展,保障停车场安保新项目的正常、顺利开展,特制定安保从业人员的业务技能及个人素质的培训计划 外显子测序因为有一个杂交捕获的过程,这样就会有一个杂交捕获效率的问题。各个外显子的杂交效率是不同的,其同源竞争的情况也不同,所以不同的外显子的覆盖率的差异就很大。所以一般情况下,外显子测序不能用于CN
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