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1、HEREDITAS(Beijing)2011年8月,33(8):847―856ISSN0253-9772www.chinagene.cn综述DOI:10.3724/SP.J.1005.2011.00847全基因组外显子测序及其应用张鑫,李敏,张学军安徽医科大学皮肤病研究所,合肥230032摘要:近年来,众多研究小组开展了大量的全基因组关联研究(Genome-wideassociationstudies,GWAS),发现并鉴定了许多与复杂疾病/性状相关联的遗传变异,为复杂疾病发病机制的研究提供了重要
2、线索。由于GWAS的结果存在假阳性、假阴性、检测到的单核苷酸多态性很少位于功能区以及对稀有变异和结构变异不敏感等问题,导致了其应用的局限性。而新一代测序技术的进步,促进了全基因组测序和全基因组外显子测序的快速发展,为解决上述问题提供了契机。全基因组外显子测序是利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。由于其具有对常见和罕见变异高灵敏度,能发现外显子区绝大部分疾病相关变异以及仅需要对约1%的基因组进行测序等优点,促使全基因组外显子测序成为鉴定孟德尔疾病的致
3、病基因最有效的策略,也被运用于复杂疾病易感基因的研究和临床诊断中。关键词:外显子测序;孟德尔疾病;复杂疾病;临床诊断ExomesequencinganditsapplicationZHANGXin,LIMin,ZHANGXue-JunInstituteofDermatologyofAnhuiMedicalUniversity,Hefei230032,ChinaAbstract:Inrecentyears,researchershaveidentifiedalargenumberofcomplexd
4、iseases/traits-associatedgeneticvari-antsbyperforminggenome-wideassociationstudies(GWAS),whichmayprovideimportantcluesonunderstandingthemechanismsofrelateddiseases.However,GWAShasitsownlimitationsintermsofbeingfalsepositive,falsenegativeresults,veryfe
5、wSNPslocatedinthefunctionalareasandinsensitivetodetectrareandstructuralvariations,whichresultsintheapplicationlimitationofthismethod.Withthedevelopmentofthenext-generationsequencingtechnology,wholege-nomeandexomesequencingdevelopedrapidlyandprovideano
6、pportunityforustodealwiththeproblemcausedbyGWAS.Thishigh-throughputsequencingtechnologyisappliedforsequencingtheexome(1%ofgenome)todiscovermostofthediseases-relatedvariationsinexons.Furthermore,itishighlyeffectivetodetectcommonandrarevariations.Duetot
7、heseadvantages,exomesequencinghasbecomeapowerfulandefficientstrategyforidentifyingthegenesresponsibleformendeliandisordersandcomplexdiseases,whichwillbeveryhelpfulforthediseasesclinicaldiagnosis.Keywords:exomesequencing;mendeliandisorders;complexdisea
8、ses;clinicaldiagnosis随着人类基因组计划(Humangenomeproject,tionalHapMapproject)的完成以及高通量生物芯片HGP)和国际人类基因组单体型图计划(Theinterna-技术的成功研发,人们广泛利用高通量全基因组生收稿日期:2000−00−00;修回日期:2000−00−00基金项目:国家高技术研究发展计划项目(863计划)(编号：2007AA02Z161)资助作者简介:张鑫,博士,研究方向：复杂疾病遗传学。E-mail:zha
