dna甲基化芯片技术服务

《dna甲基化芯片技术服务》由会员上传分享，免费在线阅读，更多相关内容在应用文档-天天文库。

1、康成生物甲基化芯片技术服务DNA甲基化在人的正常发育、X染色体失活、衰老以及许多人类疾病（如发育畸形、癌症、心血管疾病、糖尿病和神经心理失调等）过程中发挥重要作用。通过MeDIP(甲基化DNA免疫共沉淀)与甲基化芯片结合，研究者可快速高通量地发现靶基因组上的甲基化区域，比较不同细胞、组织、肿瘤样本间的DNA甲基化差异。康成生物为您提供Agilent公司甲基化芯片全程技术服务。您只需要提供保存完好的组织或细胞标本，康成的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作，并为您提供包括实验方法、实验数据与图表的详细实验报告。AgilentDNA甲基化芯片通过SurePrint芯片合成专利技术、优化探

2、针设计、及实验方法，Agilent的甲基化芯片可灵活进行甲基化研究，得到高灵敏度、高特异性、高重复性的结果。l高覆盖面，高解析度的探针每个甲基化芯片上都集成有约244,000个60-mer的寡聚核苷酸探针，视设计方案不同这些探针以100-300bp的平均间隔覆盖研究者感兴趣的UCSC数据库中所有的CpG岛和RefSeq数据库中所有已研究清楚的约17000个转录本。l优异的芯片质量Agilent公司拥有众多芯片专利技术，每个芯片探针都经反复实验筛选优化而来，使用双色标记系统比单色标记系统得到灵敏度和精确度更高、重复性更好的结果，既可以有效地检测出弱的、低频DNA甲基化水平改变，又可以在同一

3、张芯片上直接比较不同样本的差异。l快速的芯片更新Agilent公司的SurePrint专利技术可以实现在1＂x3＂的玻璃片基上灵活地大规模地原位合成芯片探针，该技术可以很快很灵活地响应最新的探针设计，使研究者快速、容易地得到高质量的、最新的芯片。l可灵活定制的芯片Agilent公司有完整的探针集供研究者选择，研究者可根据感兴趣的组织、基因组区域自己定制各种不同探针密度的芯片。l严格的质控体系为了保证实验结果的可靠性，从基因组DNA片断的大小到染色质免疫共沉淀的成功与否都有完善的质控措施。l专业的数据处理软件Agilent公司专门设计了ChIPAnalyticsSoftware软件处理甲基

4、化芯片数据，保证研究者更好检测出DNA甲基化事件并降低错判率。该软件还有可视化数据浏览器功能，研究者可方便的将数据定位到基因组上，结合各种已有的基因组注释进行研究甲基化芯片技术示意图A．将基因组DNA超声打断成400bp-500bpDNA片段；B．加热变性并将变性后的单链DNA样品分成两份；C．其中一份单链DNA样品加入抗5’-甲基化胞嘧啶核苷抗体。D．使用免疫磁珠法分离C步样品中甲基化DNA片段的抗体复合物，样品中其余的非甲基化DNA片段被洗脱；E．纯化免疫共沉淀的DNA片段（MeDIP）；视需要可对MeDIP与Input样品进行扩增；F．对MeDIP(Cy5)与Input(Cy3)样

5、品分别进行标记；G．标记后的MeDIP与Input样品混合、变性，与DNA微阵列芯片杂交；H．用高解析度芯片扫描仪检测杂交信号；对杂交结果进行数据提取、标准化、峰值分析、报告。Agilent甲基化芯片产品列表：Agilent芯片格式探针解析度描述HumanCpGIslands244Kx1195K探针在CpG岛内，50K探针在CpG岛间探针平均间距95bp数据来源UCSChg17(NCBIBuild35)覆盖约27800个CpG岛MouseCpGIslands2x105K97652个CpG岛探针探针平均间距95bp数据来源UCSCmm8(NCBIBuild36)覆盖16030个CpG岛Hu

6、manPromoter244Kx2探针覆盖转录起始位点上游5.5kb至下游2.5kb平均每基因探针数25个探针平均间距195bp数据来源UCSChg17(NCBIBuild35)覆盖约17000个RefSeq数据库中已研究清楚人转录本的启动子MousePromoter244Kx2探针覆盖转录起始位点上游5.5kb至下游2.5kb平均每基因探针数25个探针平均间距200bp数据来源UCSCmm7(NCBIBuild35)覆盖约17000个RefSeq数据库中已研究清楚小鼠转录本的启动子康成生物为您提供NimbleGen公司甲基化芯片全程技术服务。您只需要提供保存完好的组织或细胞标本，康成的

7、芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作，并为您提供包括实验方法、实验数据与图表的详细实验报告。NimbleGenDNA甲基化芯片NimbleGen的专利光导合成技术可制作高密度的长片断Oligo探针（50-85mer）芯片，结合高严谨度的杂交方法可得到具高灵敏度和特异性的结果，另外，因为NimbleGen公司的DNA甲基化检测实验使用双色标记（Cy3/Cy5），同一张芯片上的信号变异几乎可以忽略。图A用NimbleGen公司的芯片