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时间:2018-12-15
《分子生物学软件全列举.docx》由会员上传分享,免费在线阅读,更多相关内容在学术论文-天天文库。
1、1.三维分子类RASMOL:观看生物分子3D微观立体结构RasTop:为RasMol2.7.1的图形用户界面软件CHIME:直接在浏览器中观看3D分子MolMol:将pdb等格式的蛋白文件通过微调,存成普通的图形文件raswin.exe.gz:rasmol(win)2.7.0.1rasmol新版本及汉化版本CrystInfo:用来快速、容易地构建、观察与检查晶体3D结构PDViewer:PDB格式文件的查看程序WeblabViewlite:三维分子浏览工具及大量分子文件例子WeblabViewerPro:三维分子浏览工具ICMLite:三维分子浏览工具,有一些其他软件没有的功能
2、VMD:三维分子浏览工具,可以进行动态显示CN3D:3D分子结构观察软件WPDB:PDB文件检索显示分析软件DTMM:三维分子模型显示、编辑与构建程序Mole:高性能的大分子三维图形显示计算工具gopenmol:显示并分析分子结构及其特性POV-Rayv:生成三维图像工具软件MolPOV:将PDB文件转化为POV格式文件的软件Mol2Mol:分子文件格式转换软件PovChem:将PDB文件转化为POV格式的文件Ortep-3forWindows:生成分子的热椭圆形点图PLATON:通用结晶学软件工具Mage:读取并演示Kinemage格式文件的专用软件Prekin:将PDB格式
3、文件转换为Kinemage格式文件Swiss-PdbViewer:PDB文件显示与分析软件DINAMO:蛋白序列排队比较编辑与三维模型构建工具PCMoleeule2Lite:查看PDB格式文件的免费软件StrukEd:化学分子编辑与三维模型生成软件JMVC:使用JAVA技术编写的三维分子查看器ReView:读取及分析XYZ格式三维分子文件Oscail:用来处理、定义与检查小分子单晶的软件包Moilin:分子构建与观察软件Tinker:与Moilin配套的DOS下的分子设计建模Biodesigner:免费的分子建模与显示软件MoluCAD:全功能的分子建模与显示工具软件Viewe
4、rActivexControl:三维分子显示控件MarvinView:JAVA语言编写的化学分子二维与三维显示程序ACD/3DViewerforISIS:免费的ISISDraw三维显示插件Amira:高等三维显示建模系统AmiraMol:Amira2.3相应的显示三维分子的增强工具Visualize:分子建模和研究软件包ScientificGL:C++OpenGLAPI三维分子开发工具Sojourner:找出小蛋白的最小能量构形并实时演示的软件2.DNA分析DNAClub:DNA处理软件JaMBW:分子生物学软件包DNATool:功能很全面的DNA序列分析工具包pDRAW:DN
5、A分析与绘图软件,可绘制线性或环形DNA图ANNHYB:用来帮助进行PCR引物设计与基因探针设计的软件RESTRICTIONANALYSIS:限制酶消化工具ABIView:ABI格式文件显示与编辑软件Chromas:ABI格式文件显示与编辑软件Sequenceviewer:获取与观察从GSDB获取的DNA序列数据及其关联特性的工具DNAssist:DNA序列分析工具DNAProbe:核苷酸序列设计工具DnaSP:DNA序列种群遗传学分析软件DFW:DNA分析软件ArtemisR4:以Java语言写成的序列查看工具’ACTR1:以Java语言写成的序列比较查看器GDA:主要用来进
6、行不连续基因数据的统计分析RDP:从一组排队比较(Align)的核酸序列中查找潜在的重组体软件Sequencher:装配DNA小片段为大的连续序列或毗连(序列)群"Contig"软件MehCalc:自动计算DNA序列热力学数据的Excel电子表格宏软件基因探索者:中文界面的功能集成、高效、快捷的基因分析软件ConsInspector:DNA蛋白结合位点预测识别软件MatInd与Matlnspector:快速匹配DNA序列与已知共有序列的软件工具GBuilder:JAVA语言编制的用来分析与显示DNA序列的软件GenomePixelizer:帮助理解基因组中的簇基因(C1uste
7、rmggene)之间的相互关系的软件LabBookGenomicXMLViewer:图形化显示并处理GenBank序列数据的免费软件GeneConstruetionKit2:管理并显示克隆策略中的分子构建过程软件Genalysis:比较基因组或大量基因序列的工具软件3.RNA分析RNAdraw:RNA二级结构分析软件RNAstructure:预测RNA级结构图RnaViz:RNA二级结构图绘制程序4.蛋白质分析ANTHEPROT:蛋白序列分析软件包pSAAM:蛋白序列分析软件包VHMPT:螺
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