核桃(juglans regis l.)ssr开发及其应用

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1、关于学位论文原创性和使用授权的声明本人所呈交的学位论文，是在导师指导下，独立进行科学研究所取得的成果。对在论文研究期间给予指导、帮助和做出重要贡献的个人或集体，均在文中明确说明。本声明的法律责任由本人承担。本人完全了解山东农业大学有关保留和使用学位论文的规定，同意学校保留和按要求向国家有关部门或机构送交论文纸质本和电子版，允许论文被查阅和借阅。本人授权山东农业大学可以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文和汇编本学位论文，同时授权中国科学技术信息研究所将本学位论文收录到《中国学位论文全文数据库》，并向社会公众提供信息服务。保密论文在解

2、密后应遵守此规定。论文作者签名：导师签名：墼靼一钦一日万方数据符号说明㈣Y㈣Zm7㈣8帅7Ⅲ川Ⅲ1舢8Ⅲ5AFLP：AmplifiedFragmentLengthPolymorphism，扩增片段长度多态性BSA：Bulkedsegregantanalsis，群体分离分析法CTAB：Cetyl．Trimethyl．AmmoniumBromide，溴化十六烷基三乙基胺dNTP：Deocyribonucleosidetriphosphate，脱氧核糖核苷三磷酸EB：Ethidiumbromide，溴化乙锭EDTA：EthyleneDiaminetetraaceticAcid，乙二胺四乙酸ES

3、T：ExpressedSequenceTag，表达序列标签IPTG：Isopropyl．p．D．1．thiogalactopyranoside，异丙基-p-D·硫代吡喃半乳糖苷Na：Numberofalleles，观察等位基因数Ne：Effectivenumberofalleles，有效等位基因数NCBI：NationalCemerforBiotechnologyInformation，美国国立生物技术信息中心PCR：Polymerasechainreaction，聚合酶链式反应PIC：Ploymorphisminformationcontent，多态信息含量PVP：Polyvinylp

4、lpyrrolidone，聚乙烯吡咯烷酮SCAR：Sequencecharacterizedamplifiedregions，特定序列扩增SSR：SimpleSequenceRepeatorMicrosatellite，微卫星标记TE：Trisbase／EDTAbuffer，TrisEDTA缓冲液X．gal：5-Bromo．4．chloro．3．indolyl13-O．galactopyranoside，5-溴-4-氯一3一吲哚-p-D一吡喃半乳糖苷万方数据目录中文摘要．．．．．IAbstract．II1弓I言．．．．．．．．．．．11．1SSR标记的开发与应用11．1．1SSR标记的概

5、念11．1．2SSR分子标记的开发l1．1．3SSR在核桃育种中的应用21．2植物指纹图谱．．31．3质量性状分子标记．．41．3．1群体构建及定位策略41．3．2BSA法的特点51．3．3BSA法的应用61．4SCAR标记在林木育种中的应用61．5本研究的目的意义．．72材料与方法．72．1植物材料．．72．2试验试剂．．82．3试验仪器．．82．4试验方法．．82．4．1抗性鉴定82．4．2核桃基因组DNA提取与基因池的构建92．4．3EST序列SSR位点分析及SSR引物设计102．4．4SSR引物的筛选．．102．4．5数据收集与分析．122．4．6SSR片段的克隆与测序．．122

6、．4．7SCAR引物的设计及鉴定．．152．5技术路线153结果与分析．163．1核桃EST．SSR引物的开发．．163．1．1核桃SSR位点密度163．1．2核桃SSR位点重复单元和重复类型163．1．3SSR引物筛选．．173．2核桃栽培品种指纹鉴定183．2．1SSR引物的筛选．．183．2．2SSR指纹图谱．．183．2．37个样本的聚类分析193．3核桃抗炭疽病相关SSR标记的筛选203．3．1核桃炭疽病抗性评价．203．3．2核桃基因组DNA的提取．．2l3．3．3SSR特异引物的筛选．．21万方数据4．讨论．．．．．：144．1DNA的提取与聚丙烯酰胺凝胶电泳244．2核桃

7、EST．SSR特性分析．．244．3核桃EST．SSR多态性分析．．254．4核桃指纹图谱与聚类分析254．5抗炭疽病相关标记的筛选265．结论．26参考文献28附录：相关试剂的配制．．39致谢．．．．．．．41万方数据山东农业大学硕士学位论文核05(JuglansregiaL．)SSR开发及其应用中文摘要核桃(JuglansregiaL．)是一种重要的经济、生态林木树种。本研究利用核桃转录组数据进行EST．SSR标记的开发，以7个