人dna修复基因hogg1真核表达载体的构建及序列测定论文

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1、人DNA修复基因HOGG1真核表达载体的构建及序列测定论文魏永长,南克俊,惠凌云,贺大林【关键词】遗传载体;HOGG1基因;克隆,分子;DNA修复ConstructionandsequencingofeukaryoticexpressionvectorofhumanDNAbaseexcisionrepairgeneHOGG1【Abstract】AIM:ToclonehumanDNAbaseexcisionrepairgene,8oxoguanineDNAglycosylase(HOGG1),andconstructitseuk

2、aryoticexpressionvectorthelivertissueofhumanfoetusbytheguanidiniumthiocyanatemethod.TheplifiedbyRTPCRandclonedintoeukaryoticexpressionvectorpCMVMyc.PlasmidDNAeanalysis.ClonesrepresentingcDNAinsertsoleculor;DNArepair【摘要】目的:克隆人HOGG1基因并构建其真核表达载体,进行序列测定.方法:提取人胎肝总RNA,设计H

3、OGG1特异性引物,通过RTPCR扩增,将HOGG1基因克隆到pCMVMyc载体,菌落PCR鉴定阳性克隆并测序验证.结果:获得人HOGG1基因全长.freele公司);pCMVMyc载体试剂盒(Cloech公司);RNA酶抑制剂和MMLV逆转录酶(Promega公司);Taq酶、DH5α感受态细菌、凝胶回收试验盒、所有寡核苷酸和引物及克隆测序均由上海申能博彩公司提供.其他试剂为通用高纯试剂.DNA扩增采用PE9600扩增仪.1.2方法1.2.1RTPCR扩增HOGG1基因取来自于意外流产的100mg人胎肝组织,在液氮中研磨至粉

4、末状,加入1mLTrizol,按产品提供的操作手册抽提总RNA.紫外吸收测定法检测RNA浓度和纯度,使A260nm/A280nm比值在1.8~2.1之间.变性琼脂糖凝胶电泳,紫外透射光下观察并拍照.在2mg总RNA中,加入DEPCH2O,使总体积为8mL,加入0.5mLRNA酶抑制剂、2mLoligo(dT)引物、400UMMLVRT逆转录合成cDNA第一链,逆转录反应为37℃1h,90℃5min,冰上冷却,室温高速离心5s.将cDNA溶液储存于-20℃备用.参考GenBank登录的HOGG1基因的cDNA序列(NM_0168

5、20.2)设计扩增HOGG1全长的引物.上游引物序列为F(EcoRI):5′AGAGAATTCGGATGCCTGCCCGCGCGCTTCTG3′,上游引物从起始密码子ATG开始.R(KpnI)下游引物序列为:5′TTTCTGGTACCGATAAAACCATCCTTAGCG3′,终止于终止密码子TGA,即该序列中的TCA.分别在上游引物5′,下游引物3′端引入EcoRI和KpnI的酶切位点,目的是为了克隆到真核表达载体pCMVMyc对应的位点中.预期扩增产物长度为1233bp.PCR反应体系50μL:25mmol/L的PCR特异

6、引物各1μL,Taq聚合酶0.5μL,dNTP混合液0.5μL,cDNA2μL.扩增条件:94℃变性5min,94℃30s,55℃40s,72℃40s,35个循环后,72℃延伸10min.PCR扩增产物用12g/L琼脂糖电泳,胶回收试剂盒回收目的条带.1.2.2HOGG1基因真核表达载体的构建及鉴定PCR扩增产物用EcoRI和KpnI双酶切2h,凝胶回收试剂盒回收DNA,该片段与同样双酶切回收后的pCMVMyc载体连接,转化宿主E.coliDH5a感受态细胞(氯化钙法),挑取单克隆白色菌落筛选重组质粒.重组克隆用克隆PCR方法

7、鉴定,鉴定引物为载体测序引物CMVF和扩增HOGG1的下游引物,扩增条件同上,扩增产物大小正确的克隆,用含氨苄青霉素(100mg/L)的LB培养,用质粒制备试剂盒制备质粒,阳性用于序列测定.2结果2.2.1HOGG1基因扩增成功地扩增出全长的HOGG1基因.图1为RTPCR的扩增产物,电泳可见1200bp左右的扩增条带,与预计的大小基本吻合.2.2.2构建HOGG1基因真核表达载体通过RTPCR扩增HOGG1获得PCR产物,经过胶回收酶切产物,回收直接克隆到pCMVmyc载体对应的位点,转化大肠杆菌.通过菌落PCR方法,初步筛

8、选出重组克隆(图2).随机挑选出5个克隆,其中一克隆(泳道1),与其他4个克隆(泳道25)相比,插入片段偏小,没有做进一步分析.泳道2~5共4个克隆插入大小一致,经过测序分析,结果表明这4个克隆的插入片段为HOGG1基因.通过序列分析和比较部分克隆的序列与预计的不同,泳道5对

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