新的肾上腺脑白质营养不良基因突变1例的鉴定论文

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1、新的肾上腺脑白质营养不良基因突变1例的鉴定论文兰风华杨渤生卢爱薇黄梁浒朱忠勇【关键词】肾上腺白质营养不良IdentificationofanovelmutationintheALDgeneofaChinesepatientutationalgenotypeinaChinesefamilytheperipheralbloodofthepatientandALDmRNAplifiedbylongRTPCR.ThePCRproductsentspanningthemutationplifiedfromthegenomicDNAofthepatientandhisfamilym

2、embersanddigestedeBspLI.RESULTS:Cutationhismother,utation.Hisfatherandsisterthismutation.CONCLUSION:Anovelmutation,theP508Lmutation,isfoundintheALDgeneofaChinesepatientutation,missense;ALDprotein【摘要】目的:对1例肾上腺脑白质营养不良(ALD)患者及其家系成员的ALD基因的突变类型进行鉴定.方法:以外周血RNA为模板,采用长链RTPCR技术,分4个片段扩增ALD基因mRNA的编

3、码序列,对4个PCR产物进行直接测序,筛查整个基因编码区.通过限制性内切酶酶切分析患者及其家系成员基因组ALD基因片段,以进一步确证所发现的基因突变.结果:位于患者ALD基因第6外显子的第508位密码子存在一个新的错义突变CCC→CTC(P508L),患者母亲为突变携带者,患者父亲和妹妹不存在此突变.结论:发现中国ALD患者一个新的ALD基因突变.freelgL-1,22碳饱和脂肪酸(C22∶0)浓度:9.05mgL-1,两个浓度比(C24∶0/C22∶0)等于1.49(正常范围0.939左右).患者非近亲婚配所生,另有一妹妹,无家族史.临床诊断:肾上腺脑白质营养不良(

4、儿童脑型).1.2方法ALD基因的mRNA长3.7kb,其中编码区为2238bp.本研究合成4对引物[2],即:PIF和RT1,PⅡF和RT2,PⅢF和RT3,PⅣF和RT4,分4段(自5′端依次为ALD1,ALD2,.freelL,按Qiagen产品(RNeasyMiniKit)说明书提取总RNA.长链RTPCR按TaKaRa试剂盒(RNALAPCRTMKit)说明书进行.先进行反转录,然后在PE2400型热循环仪上进行PCR反应:94℃变性2min后,按94℃30s,60℃30s,72℃2min循环30次.最后一个循环结束后继续在72℃延伸8min.将上述PCR混合

5、物10~20μL上样于15gL-1的琼脂糖凝胶电泳,切下含预期片段(2440bp)的胶块,利用Qiagen的DNA凝胶回收试剂盒(QIAquickGelExtractionkit)从胶块中回收DNA.以此DNA为模板,组配4个2次PCR反应:反应体积50μL,含模板1ng,引物各25pmol,4种dNTP各0.2mmolL-1,Taq酶(BioAsia)2.5U,MgCl21.5mmolL-1,分别扩增ALD1,ALD2,ALD3,ALD4,扩增条件统一为:94℃预变性2min后,按94℃30s,50℃30s,72℃60s进行10~15个循环,最后一个循环结束后继续在7

6、2℃延伸9min.用Qiagen的PCR产物纯化试剂盒(QIAquickPCRPurificationKit)直接从PCR混合液中纯化PCR产物.将纯化的4个片段连同相应PCR引物,寄上海博亚生物技术有限公司进行序列测定.1.2.2基因组DNA片段扩增和限制性内切酶分析患者及其家庭成员的外周血基因组DNA使用Qiagen的DNA提取试剂盒(QIAampDNABloodMiniKit)提取.根据突变所在部位,用Omiga2.0软件设计针对外显子6全长序列的PCR引物,上游引物(PA5F)序列为:5′CTGCGCTCTCTGGCGTCA3′,下游引物(PA5R)序列为:5′

7、CACAGCCCGTCTCTGGCT3′,预期扩增片段长330bp.扩增条件:95℃预变性4min后,按94℃30s,55℃30s,72℃30s进行30个循环.用Qiagen的PCR产物纯化试剂盒(QIAquickPCRPurificationKit)从PCR混合液中纯化PCR产物.根据突变的性质,用限制性内切酶BspLI(MBIFermentas)对纯化的PCR产物进行酶切,于100gL-1聚丙烯酰胺凝胶上电泳,溴化乙啶染色后用美国BioRad公司的FluorS型凝胶成像仪采集电泳结果.2结果2.1ALD基因mRNA的RTPCR扩增及测

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