精准医学的基础研究与临床转化

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1、精准医学的基础研究与临床转化-->人类基因组计划的完成使得人类得以从基因的角度透析疾病。而后分子和细胞生物学的多层次的表观基因组、转录组、蛋白质组、脂质组、微生物组、代谢组以及暴露组的研究使得能够从分子和细胞水平解读疾病发生和发展。同时,大量临床试验数据及经验的积累,为实施大规模队列研究和人类表型组计划打下基础。测序技术的迅猛发展以及超级计算机对生物大数据的处理能力也使得精确分析表型与遗传因素之间关系成为可能。组学研究A

2、380;大规模队列试验和数据处理是精准医学的核心。精准医学是综合个体遗传因素及环境因素信息与表型关联的个体化医学模式,是在大数据驱动下的一门多学科交叉学科。鉴于我国巨大的医疗资源需求的现状,研究和实施适合我国国情的精准医学计划旨在解决以“群体”为对象的传统医学诊断误差大、用药非精准以及医疗资源浪费大的难题,具有积极的社会意义和经济意义。本文就精准医学的提出和发展基础,以及国内相关研究进展进行综述。1从循证医学到精准医学在2008年提出以表述分子诊断使得医生不用依赖于直觉和经验便可以

3、明确诊断。循证医学时代强调“群体”的临床证据,而忽视了“个体”的复杂性以及“个体”的遗传特性和环境因素的差异性。循证医学过分关注群体统计学差异,忽视了临床实践的真正意义;而精准医学正是关注于“个体”:这便决定未来的医学模式将从循证医学转变为精准医学。“精准医学(precisionmedicine)”一词最早是由哈佛大学商学院商业战略家ClaytonChristensen但是,当时这个描述并没有引起太多的关注。2011年美国国立研究委员会下属的“发展新疾病分类法框架委员会”发表的《迈向精准医学:建

4、立一个生物医学知识网络和一个新疾病分类法框架》蓝图,作为“个体化医学”的新表述形式,“精准医学”才开始被广泛重视。精准医学是指为每位病患的个体特征制定医疗方案,根据对某种疾病的易感性或特定治疗方案的反应将患者个体分成亚群;然后将预防或治疗措施集中于有效病患,而免去给无效患者带来费用和副作用。“精准”包括“准确(accurate)”和“精密(precise)”两重含义。精准医学根据病人个体特异性制定个性化精准预防、精准诊断和精准治疗方案,是具有颠覆性的医学新模式。2015年初,奥巴马

5、政府在国情咨文中提出美国的“精准医学计划(precisionmedicineinitiative,PMI)”,并为精准医学计划的5个具体内容在2016财年预算案中提出2.15亿美元预算。“精准医学计划”是以遗传信息的发现和人类基因组计划的实施为基础,依靠百万志愿者的基因组信息和临床信息的大数据来支撑癌症与其它多基因病研究,转变相关管理部门的监管方式,寻求公立机构和私立机构良好合作的大型全国性乃至全球性前瞻性项目。从循证医学到精准医学是一个粗放到精确的过程:循证医学关注于“群体”统计学差异,精准医学则关注于“个体”组学特征;

6、循证医学强调随机对照数据,精准医学强调分子生物学证据。2精准医学研究的核心和基础基因组研究中新产生的流行病学数据转换为与未来临床应用相关的信息。组学技术的质量和标准是精准医学的关键之一。精准医学临床转化的基础和关键环节:通过对患者遗传特性的研究和分型,在我国原创抗癌新药西达本胺(组蛋白去乙酰化酶抑制剂)的研发和上市过程中,药物基因组学便起到了极大的促进作用。精准医学研究的主要目的是通过标准化的各种大型的队列研究和多种组学研究,寻找疾病的新的生物标志物以完善疾病分类;完善后的新疾病分型通过药物基因

7、组学等手段进行临床转化,达到个体化的精准医疗(Fig2)。其中大型队列研究是精准医学的核心;多种组学研究是精准医学的基础,其中药物基因组学、药物表观基因组学以及药物蛋白组学等是精准医疗临床转化的桥梁;大数据的标准化处理与发掘是精准医学的重要凭据。2.1大型队列研究作为精准医学研究的核心,大规模队列研究通过对大规模健康和疾病人群的随访信息和临床样本的收集,进行多层次综合性的组学研究,有利于发现疾病早期诊疗的生物标志物。其中新药临床试验由于规范度高、标准化好等优势,是精准医学大规模队列

8、研究中规范样本和表型数据的重要。医院生物样本和临床信息是精准医学的宝贵资源和重要前提,由于其复

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