栀子及其近缘类群的随机扩增多态dna分析论文

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1、栀子及其近缘类群的随机扩增多态DNA分析论文【摘要】目的探索栀子与其变种雀舌栀子、重瓣栀子及变型水栀子之间的亲缘关系。方法从56个随机引物中筛选出12个引物对栀子及其近缘类群进行RAPD分析,应用SPSS10.0分析软件中的Jaccard方法计算任意两样品间的相似系数,用组内聚类方法计算得出聚类树状图。结果共得到251个有效位点。聚类分析显示,栀子与重瓣栀子最先聚类,然后与水栀子聚类,最后与雀舌栀子聚类。结论重瓣栀子与栀子亲缘关系最近,雀舌栀子与栀子的亲缘关系最远。【关键词】栀子;近缘类群;随机扩增多态

2、DNARAPDAnalysisforGardeniajasminoidesandRelativesAbstract:ObjectiveToproberelativerelationshipamongGardeniajasminoides,itsvarietas(G.jasminoidesEllis.var.radicansandG.jasminoidesEllis.var.fortuniana)anditsforma(G.jasminoidesEllis.f.longicarpa).MethodsRAP

3、DanalysisforsamplesofGardeniajasminoidesandrelativesedby12randomprimersscreenedfrom56.Proximitymatrixorphiclociplified.ItshoinoidesinoidesEllis.var.fortunianaatfirst,theninoidesEllis.f.longicarpa,andinoidesEllis.var.radicansatlast.ConclusionAmongsamples,

4、GardeniajasminoidesinoidesEllis.var.fortuniana,andmostdistantrelativetoG.jasminoidesEllis.var.radicans.Keyinoides;Relatives;RAPD栀子为常用中药.freelinoidesEllis.、雀舌栀子G.jasminoidesEllis.var.radicans(Thunb.)Makino、重瓣栀子G.jasminoidesEllis.var.fortuniana(Lindl.)Hara

5、.、大花栀子G.jasminodesvar.grandifloraNakai.、水栀子G.jasminoidesEllis.f.longicarpaZ.ProgrammableThermalController(MJRESEARCHINC,美国),高速离心机IECMicro-MBcentrifuge(IEC公司,美国),DZKgCl225mmol·L-11.5μl,10×ReactionBuffer2.5μl。扩增程序为:预变性96℃,5min;扩增循环40个,为94℃45s,34℃1min,72℃1.

6、5min;后延伸72℃5min。取8μl扩增产物于1.8%琼脂糖凝胶上用1×TAE电泳缓冲液电泳,凝胶紫外成像系统检测拍照。2.4引物筛选以1和2号两个模板,用随机引物在上述条件下扩增,选择条带清晰、重复性好的引物作为扩增引物用于RAPD扩增。2.5数据分析电泳图谱中的每一条带(DNA片段)均为一个分子标记,并代表一个引物结合点,根据分子标记的有无及其迁移率统计得到有位点的二元数据,有带计为1(强带与弱带同计),无带计为0。应用SPSS10.0分析软件中的Jaccard方法计算任意两样品间的相似系数,用

7、].杭州:浙江科学技术出版社,1974:1212.[3]吴修仁.广东药用植物简编[M].广州:广东高等教育出版社,1989:450.[4]徐国钧.中药材粉末显微鉴定[M].北京:人民卫生出版社,1986:472.[5]中国科学院植物研究所.江苏南部种子植物手册[M].北京:科学出版社,1959:706.[6]谢宗万.全国中草药汇编,第2版(上册)[M].北京:人民卫生出版社,1999:766.[7]付小梅,赖学文,葛菲,等.中药栀子类药材资源调查和商品药材鉴定[J].中国野生植物资源,2002,21(5

8、):23.[8]吕雪梅,..毕业杨关福,张细权.RAPD分析中遗传距离计算方法的比较[J].华南农业大学学报,1997,18(增刊):90.

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1、栀子及其近缘类群的随机扩增多态DNA分析论文【摘要】目的探索栀子与其变种雀舌栀子、重瓣栀子及变型水栀子之间的亲缘关系。方法从56个随机引物中筛选出12个引物对栀子及其近缘类群进行RAPD分析,应用SPSS10.0分析软件中的Jaccard方法计算任意两样品间的相似系数,用组内聚类方法计算得出聚类树状图。结果共得到251个有效位点。聚类分析显示,栀子与重瓣栀子最先聚类,然后与水栀子聚类,最后与雀舌栀子聚类。结论重瓣栀子与栀子亲缘关系最近,雀舌栀子与栀子的亲缘关系最远。【关键词】栀子;近缘类群;随机扩增多态

2、DNARAPDAnalysisforGardeniajasminoidesandRelativesAbstract:ObjectiveToproberelativerelationshipamongGardeniajasminoides,itsvarietas(G.jasminoidesEllis.var.radicansandG.jasminoidesEllis.var.fortuniana)anditsforma(G.jasminoidesEllis.f.longicarpa).MethodsRAP

3、DanalysisforsamplesofGardeniajasminoidesandrelativesedby12randomprimersscreenedfrom56.Proximitymatrixorphiclociplified.ItshoinoidesinoidesEllis.var.fortunianaatfirst,theninoidesEllis.f.longicarpa,andinoidesEllis.var.radicansatlast.ConclusionAmongsamples,

4、GardeniajasminoidesinoidesEllis.var.fortuniana,andmostdistantrelativetoG.jasminoidesEllis.var.radicans.Keyinoides;Relatives;RAPD栀子为常用中药.freelinoidesEllis.、雀舌栀子G.jasminoidesEllis.var.radicans(Thunb.)Makino、重瓣栀子G.jasminoidesEllis.var.fortuniana(Lindl.)Hara

5、.、大花栀子G.jasminodesvar.grandifloraNakai.、水栀子G.jasminoidesEllis.f.longicarpaZ.ProgrammableThermalController(MJRESEARCHINC,美国),高速离心机IECMicro-MBcentrifuge(IEC公司,美国),DZKgCl225mmol·L-11.5μl,10×ReactionBuffer2.5μl。扩增程序为:预变性96℃,5min;扩增循环40个,为94℃45s,34℃1min,72℃1.

6、5min;后延伸72℃5min。取8μl扩增产物于1.8%琼脂糖凝胶上用1×TAE电泳缓冲液电泳,凝胶紫外成像系统检测拍照。2.4引物筛选以1和2号两个模板,用随机引物在上述条件下扩增,选择条带清晰、重复性好的引物作为扩增引物用于RAPD扩增。2.5数据分析电泳图谱中的每一条带(DNA片段)均为一个分子标记,并代表一个引物结合点,根据分子标记的有无及其迁移率统计得到有位点的二元数据,有带计为1(强带与弱带同计),无带计为0。应用SPSS10.0分析软件中的Jaccard方法计算任意两样品间的相似系数,用

7、].杭州:浙江科学技术出版社,1974:1212.[3]吴修仁.广东药用植物简编[M].广州:广东高等教育出版社,1989:450.[4]徐国钧.中药材粉末显微鉴定[M].北京:人民卫生出版社,1986:472.[5]中国科学院植物研究所.江苏南部种子植物手册[M].北京:科学出版社,1959:706.[6]谢宗万.全国中草药汇编,第2版(上册)[M].北京:人民卫生出版社,1999:766.[7]付小梅,赖学文,葛菲,等.中药栀子类药材资源调查和商品药材鉴定[J].中国野生植物资源,2002,21(5

8、):23.[8]吕雪梅,..毕业杨关福,张细权.RAPD分析中遗传距离计算方法的比较[J].华南农业大学学报,1997,18(增刊):90.

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