吉林省流行麻疹野病毒的核蛋白基因特征

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1、吉林省流行麻疹野病毒的核蛋白基因特征【关键词】麻疹  麻疹是由副粘病毒科麻疹病毒属的麻疹病毒引起的急性传染病〔1,2〕。研究发现,在麻疹病毒的6个结构基因中,除了血凝素蛋白(H)以外,核蛋白(N)的基因变化较大,其中N蛋白序列的羧基端450个核苷酸的区域属于高变区。为此,我们对麻疹病毒的核蛋白基因的分子生物学进行研究,为预测和控制麻疹的发生提供科学依据。  1材料与方法  11标本收集2004年11月~2005年4月,在吉林省部分地区散发或暴发的麻疹疑似病例中采集标本,患者出疹3d内同时采集静脉血2ml(如有可能,出疹7~10d后再采

2、集1份血)和咽拭子。咽拭子保存在2ml麻疹病毒标本运输液中(含有5%牛血清和终浓度含青霉素2000U/ml、链霉素200μl/ml和制霉菌素25U/ml的细胞培养液)。用于病毒分离的标本,-80℃保存。  12病毒分离将标本4℃过夜后取05ml接种于生长良好单层的CD细胞,具有麻疹病毒的细胞受体),吸附60~120min后弃取上清,换含2%胎牛血清的胎牛血清培养液(DMEM),培养7~10d,每天观察细胞培养液pH值和细胞病变(CPE)。必要时换液或盲传1代。细胞病变>75%时收获冻存。  13病毒鉴定用兔抗麻疹免疫血清对分离株

3、作微量中和试验进行鉴定。兔抗麻疹免疫血清(长春生物制品研究所)。  14麻疹IgM抗体测定用酶联免疫吸附试验(ELISA)捕捉法检测病人血清中的麻疹IgM抗体,试剂盒(德国维润赛润生物试剂有限公司和北京贝尔生物工程公司)。  15逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、序列测定和基因分型采用酚-氯仿抽提液法提取麻疹病毒悬液中的病毒核糖核酸。参照美国疾病预防控制中心引物〔3〕。每次试验用去离子水作为阴性对照,扩增后的产物经2%琼脂糖凝胶电泳鉴定。逆转录酶和TaqDNA聚合酶(美国Biolab公司)。扩增后的PCR产物经纯化后,送上海生工生

4、物技术服务有限公司完成测序工作。调出GenBank里的22个基因型代表株N基因羧基端450个碱基对序列,用Bio-Edit软件对这些代表株和本研究所分离到的17个毒株的N基因的450个碱基序列进行对比分析,确定基因分型。  2结果  21麻疹病毒的分离和鉴定2004年11月~2005后4月,共收集经血清学确诊为麻疹暴发和散发病例标本103份,在CDW150细胞上接种,出现特殊的融合巨细胞病变,并能连续传代的17株(分别编为JL1~17)病毒经微量中和试验鉴定均为麻疹病毒。在79份暴发病例标本中分离到14株麻疹病毒,检出率为1772%;

5、24份散发病例标本中分离到3株麻疹病毒,检出率为125%。  22序列分析和基因分型(图1)对17株麻疹病毒进行了序列测定和基因分型,并对N基因羧基端450个核苷酸序列与22个已知基因型参考株的对应序列做基因亲缘性分析,结果均为H1基因型。H1基因型是麻疹病毒型内变异最大的基因型。本研究中的17株H1基因型病毒进一步分为H1a13株、H1b4株。从暴发病例分离的病毒中有11株H1a亚型和3株H1b亚型,散发病例分离的病毒中有2株H1a亚型和1株H1b亚型。H1a和H1b在450个核苷酸片段中的差异为205%~471%,H1a亚型内病毒

6、之间变异最大为13个碱基对,而H1b亚型仅有7个碱基对。  图1吉林省麻疹野病毒株与参考株的核蛋白基因亲缘性关系树(略)  3讨论  麻疹病毒是单一血清型,一直被认为病毒变异较少、相对稳定。但从20世纪80年代以来,发现一些国家从自然界分离的麻疹病毒的血凝素(HA)蛋白和N基因发生了较大的变异,与经典的Edmonston株比较有差异,与现行的疫苗株有所不同〔4,5〕。从标本中分离麻疹病毒由于受诸多条件的影响,成功率不高。通过实验发现,麻疹病毒分离成功与否,除要求生长良好的敏感细胞、保证标本低温运输保存和操作条件外,主要取决于采样时间的

7、早晚。麻疹在发病初期因症状与感冒相似常被忽视,往往在出现皮疹后才做出诊断,但此时机体内已开始产生麻疹的IgM抗体,且滴度迅速上升,使麻疹病毒排毒期在短期内结束。因此,要成功分离出麻疹病毒所使用的标本最好在出疹4d内采集。1998年].北京:科学出版社,1990:753-755.  〔2〕李凡.病原生物学[M].北京:中国协和医科大学出版社,2004:193-195.  〔3〕RotaPA.RNAextractionandreversetranscription-polymerasechainreaction(RT-PCR).Stand

8、ardprotocolsformolecularepidemiologymeaslessection[EB].CDC,2002.Availablefrom:.cdc.gov/.  〔4〕许文波,朱贞,张珍英,等.麻疹野病

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