生物信息学数据库大全

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1、综合数据库★INSD,国际核酸序列数据库（InternationalNucleotideSequenceDatabank）。由日本的DDBJ、欧洲的EMBL和美国的GenBank三家各自建立和共同维护。★EMBL库，欧洲分子生物学实验室的DNA和RNA序列库。 http://www.ebi.ac.uk/embl.html ★GenBank，美国国家生物技术信息中心（NCBI）所维护的供公众自由读取的、带注释的DNA序列的总数据库。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Web/Genbank/ ★DNADatabankofJapan(DDBJ)，日本核酸数据

2、库。 http://www.ddbj.nig.ac.jp/ ★GSDB是由美国国家基因组资源中心（NCGR）维护的DNA序列关系数据库（GenomeSequenceDataBase）。 http://www.ncgr.org/gsdb/ ★TIGRDATAbase,是世界上最大的cDNA数据库，还有大量的EST序列和人类基因索引（HGI）。 http://www.tigr.org/tdb/hcd/overview.html DNA序列数据库包括与DNA的复制、转录、修复等有密切关系的蛋白质因子。★BioSino是中国自主开发的核酸序列公共数据库。http://www.bio

3、sino.org/ ★CUTG,MM子使用频度表。http://www.dna.affrc.go.jp/~nakamura/CUTG.html http://www.kazusa.or.jp/codon/ http://www.dna.affrc.go.jp/~nakamura/CUTG.html ★EPD,真核生物启动子数据库（EukaryoticPromotorDatabase）。http://www.epd.isb-sib.ch/ ★TRANSFAC,真核生物基因表达调控因子的数据库。http://transfac.gbf.de/TRANSFAC ★TRRD.真核生物

4、基因组转录调控区数据库。http://www.mgs.bionet.nsc.ru/mgs/dbases/trrd4/ ★OOTFD,转录因子和基因表达数据库。http://www.ifti.org/ ★RepBase,真核生物DNA中重复序列数据库。http://www.girinst.org/~server/repbase.html ★MicroSatellite,微卫星重复序列数据库。http://nmnhgoph.si.edu/gopher-menus/MicroSatelliteDatabase.html ★ALU数据库是人及其他灵长类代表性的Alu重复片段。htt

5、p://ncbi.nlm.nih.gov(/pub/jmc/alu/) ★SimpleRepeats,简单重复序列库。http://ncbi.nlm.nih.gov ★COMPEL,复合元件数据库。ftp://ftp.gbf-braunschweig.de(/pub/compel/) ★MPDB,分子探针数据库。http://www.biotech.ist.unige.it/interlab/mpdb.html ★HvrBase,灵长类mtDNA调控区序列库，主要是人的HVI和HVII两个高变异区的序列。http://monolith.eva.mpg.de/hvrbase/

6、 ★PlantCARE,植物顺式作用(cis-acting)调控因子数据库。http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCare/ ★PLACE是从文献中搜集的植物顺式作用调控元件DNA模体的数据库,只涉及维管植物。http://www.dna.affrc.go.jp/htdocs/PLACE/ ftp://ftp.dna.affrc.go.jp(/pub/dna_place/place.seq)★Mendel数据库,搜集植物STS和EST序列。 http://jiio6.jic.bbsrc.ac.uk/ ★HOXPro同源异型盒(homeobox)

7、基因数据库。http://spirov.iephb.nw.ru/hox_pro/hox-pro00.html ★OPD,寡核苷酸探针数据库(OligonucleotideProbeDatabase)。http://www.cme.msu.edu/OPD/ ★dbSTS,序列标记位点(SequenceTaggedSites)数据库。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbSTS/ ftp://ncbi.nlm.nih.gov(/repository/dbSTS) ★dbEST.这是GenBank的