生物信息学数据库列表

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1、生物信息学数据库列表美国生物技术信息中心(NCBI)GenBank（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Web/Genbank/index.html）欧洲分子生物学实验室（EMBL）EMBL-Bank(http://www.ebi.ac.uk/embl/index.html)日本遗传研究所DDBJ(http://www.ddbj.nig.ac.jp/)基因组数据库：NCBI基因组数据库EntrezGenmous(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/quer

2、y.fcgi?db=Genome)人类基因组计划图谱数据库：GDB(http://www.gdb.org/)酵母基因组数据库：SGD(http://www.yeastgenome.org/)小鼠基因组信息学数据库：MGI(http://www.informatics.jax.org/)果蝇基因组数据库：FlyBase(http://flybase.bio.indiana.edu/)线虫基因组数据库：WormBase(http://www.woembase.org/)综合基因组数据库：Ensembl(http:

3、//www.ensembl.org/)表达序列标记数据库dbEST(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/)序列标记位点数据库dbSTS(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/dbSTS/)蛋白质序列数据库PIR(http://www.nbrf.georgetown.edu/pir/)SWISS-PROT(http://www.ebi.ac.uk/swissprot/)TrEMBL(http://www.ebi.ac.uk/trembl/index.html)蛋

4、白质数据仓库Uniprot(http://www.ebi.ac.uk/uniprot.index.html)生物大分子结构数据库PDB（proteindatebank）(http://www.rcsb.org/pdb/)MMDB(molecularmodelingdatabase)(http://www..ncbi.nlm.nih.gov/Structure/MMDB/mmdb.shtml)单碱基多态性数据库dbSNP(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)蛋白质结构分类数据库SC

5、OP(http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/)蛋白质二级结构数据库DSSP(http://www.sander.embl-heidelberg.de/dssp/)蛋白质同源序列比对数据库HSSP(http://www.sander.embl-heidelberg.de/hssp/)序列模式数据库PROSITE(http://www.expasy.org/prosite/)蛋白质指纹数据库PRINTS(http://www.bioinf.man.ac.uk/dbbrowser/P

6、RINTS/)人类遗传数据库OMIM(http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/entrez/query.fcgi?db=OMIM)基因启动子数据库EPD(http://www.epd.isb-sib.ch/)转录调控区域数据库TRRD(http://www.mgs.bionet.nsc.ru/trrd/)转录因子数据库TRANSFAC(http://www.gene-regulation.com/)基因本体数据库GO(http://www.geneontology.org/)生物、医学文

7、献数据库PubMed(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)目录数据库DBCat(http://www.infobiogen.fr/services/dbcat/)数据库集成ENTREZ(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/)SRS(http://srs.ebi.ac.uk/)ExPASy(http://www.expasy.org/)生物信息分析工具GCG(http://www.accelrys.com)Wisconsin软件包转基因的主要公司：Agro

8、EvoAmericanCyanamidBASFBayerDowChemicalDuPontFMCMonsantoNovartisRhone-PoulencZeneca1、生物大分子的序列是分子进化的产物，来源于共同祖先的序列倾向于表现相似的序列、结构和生物学功能。2、序列相似性是合理的预测成为可能。通常，对新序列的功能所知甚少，如能在数据库中找到相似序列，而后者的节购与功。。。相似性搜索工具十分重要