海南与越南缅甸蟒线粒体控制区遗传多样性及差异性分析

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1、海南与越南缅甸蟒线粒体控制区遗传多样性及差异性分析刘雅芳１，侯冠彧２，于萍１，赵春萍１，曹婷２，张立岭１，３（１．海南大学农学院动物科学系，海口５７０２２８；２．中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所，海南儋州５７１７３７；３．海南蟒蛇研究所，海南文昌５７１３４６）摘要：为了更有效地保护、管理和繁育缅甸蟒（Ｐｙｔｈｏｎｂｉｖｉｔｔａｔｕｓ）濒危物种，有必要利用分子技术对地方物种多样性和遗传分化进行研究。试验采用ＴＡ克隆双向测序方法对来自海南的３７条缅甸蟒和来自越南的２８条缅甸蟒部分控制区ＩＩ序列进行了测定。结果表

2、明，两个地理群体共分为２５个单倍型，单倍型多样度（Ｈｄ）为０．８７７±０．０２５，核苷酸多样性（π）为０．００４７６±０．０００４１，平均核苷酸差异数（ｋ）为２．６７６，显示缅甸蟒整体遗传多样性不高；通过比较两群体遗传多样性，发现海南缅甸蟒的单倍型多样度要高于越南缅甸蟒，但核苷酸多样性和平均核苷酸差异数低于越南缅甸蟒；基于控制区构建ＭＬ树和Ｎｅｔｗｏｒｋ网络分析显示，两群体均各自形成了明显的两大分支；通过计算得到两群体的固定指数（Ｆｓｔ）为０．２０１（Ｐ＜０．００１），显示海南缅甸蟒与越南缅甸蟒存在极显著差异。.j

3、yqkｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅｍａｒｋｅｒｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔｕｓｉｎｇｎｅｘｔｇｅｎｅｒａｔｉｏｎｐｙｒｏｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇｔｏｉｎｆｏｒｍｉｎｖａｓｉｖｅＢｕｒｍｅｓｅＰｙｔｈｏｎ－Ｐｙｔｈｏｎｍｏｌｕｒｕｓｂｉｖｉｔｔａｔｕｓ－mａｎａｇｅｍｅｎｔ［Ｊ］．ＩｎｔＪＭｏｌＳｃｉ，２０１３，１４（３）：４７９３－４８０４．［９］ＹＯＵＣＷ，ＬＩＮＹＰ，ＬＡＩＹＨ，ｅｔａｌ．Ｒｅｔｕｒｎｏｆｔｈｅｐｙｔｈｏｎｓ：ｆｉｒｓｔｆｏｒｍａｌｒｅｃｏｒｄｓ，ｗｉｔｈａｓｐｅｃｉａｌｎｏｔｅｏｎｒｅｃｏｖｅｒｙｏｆｔｈ

4、ｅＢｕｒｍｅｓｅｐｙｔｈｏｎｉｎｔｈｅｄｅｍｉｌｉｔａｒｉｚｅｄＫｉｎｍｅｎｉｓｌａｎｄｓ［Ｊ］．ＺｏｏｌｏｇｉｃａｌＳｔｕｄｉｅｓ，２０１３，ｄｏｉ：１０．１１８６／１８１０－５２２Ｘ－５２－８．［１０］ＷＲＩＧＨＴＳ．ＥｖｏｌｕｔｉｏｎａｎｄｔｈｅＧｅｎｅｔｉｃｓｏｆＰｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ．Ｖｏｌｕｍｅ４．ＶａｒｉａｂｉｌｉｔｙＷｉｔｈｉｎａｎｄＡｍｏｎｇＮａｔｕｒａｌＰｏｐｕｌａｔｉｏｎｓ［Ｍ］．Ｃｈｉｃａｇｏ：ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＣｈｉｃａｇｏＰｒｅｓｓ，１９７８．［１１］ＡＶＩＳＥＪＣ．Ｐｈｙｌｏｇｅ

5、ｏｇｒａｐｈｙｔｈｅＨｉｓｔｏｒｙａｎｄＦｏｒｍａｔｉｏｎｏｆＳｐｅｃｉｅｓ［Ｍ］．Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ：ＨａｒｖａｒｄＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙＰｒｅｓｓ，２０００．［１２］ＶＥＮＣＥＳＭ，ＴＨＯＭＡＳＭ，ＢＯＮＥＴＴＲＭ，ｅｔａｌ．ＤｅｃｉｐｈｅｒｉｎｇａｍｐｈｉｂｉａｎｄｉｖｅｒｓｉｔｙｔｈｒｏｕｇｈＤＮＡｂａｒｃｏｄｉｎｇ：ｃｈａｎｃｅｓａｎｄｃｈａｌｌｅｎｇｅｓ［Ｊ］．ＰｈｉｌＴｒａｎｓＲＳｏｃＢ，２００５，３６０（１４６２）：１８５９－１８６８．［１３］ＷＨＩＴＴＡＫＥＲＤＪ，ＭＯＲＡＬＥＳＪＣ，ＭＥＬＮＩＣＫ

6、ＤＪ．ＲｅｓｏｌｕｔｉｏｎｏｆｔｈｅＨｙｌｏｂａｔｅｓｐｈｙｌｏｇｅｎｙ：ＣｏｎｇｒｕｅｎｃｅｏｆｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤ－ｌｏｏｐｓｅｑｕｅｎｃｅｓｗｉｔｈｍｏｌｅｃｕｌａｒ，ｂｅｈａｖｉｏｒａｌ，ａｎｄｍｏｒｐｈｏｌｏｇｉｃａｌｄａｔａｓｅｔｓ［Ｊ］．ＭｏｌｅｃｕｌａｒＰｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｓａｎｄＥｖｏｌｕｔｉｏｎ，２００７，４５（２）：６２０－６２８．［１４］ＮＯＲＭＡＮＪＡ，ＭＯＲＩＴＺＣ，ＬＩＭＰＵＳＣＪ．ＭｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡｃｏｎｔｒｏｌｒｅｇｉｏｎｐｏｌｙｔｍｏｒｐｈｉｓｍｓ：ｇｅ

7、ｎｅｔｉｃｍａｒｋｅｒｓｆｏｒｅｃｏｌｏｇｉｃａｌｓｔｕｄｉｅｓｏｆｍａｒｉｎｅｔｕｒｔｌｅｓ［Ｊ］．ＭｏｌｅｃｕｌａｒＥｃｏｌｏｇｙ，１９９４，３（４）：３６３－３７３．［１５］ＢＡＲＢＥＲＰＨ．Ｐｈｙｌｏｇｅｏｇｒａｐｈｙｏｆｔｈｅｃａｎｙｏｎｔｒｅｅｆｒｏｇ，Ｈｙｌａａｒｅｎｉｃｏｌｏｒ（Ｃｏｐｅ）ｂａｓｅｄｏｎｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌＤＮＡｓｅｑｕｅｎｃｅｄａｔａ［Ｊ］．ＭｏｌｅｃｕｌａｒＥｃｏｌｏｇｙ，１９９９，８（４）：５４７-５６２．［１６］李慧芳，徐文娟，朱文奇，等．福建省家鸭的遗传多样性及其与野

8、鸭的亲缘关系［Ｊ］．生物多样性，２００８，１６（６）：６０７－６１２．（责任编辑曾德芳）