凡纳滨对虾线粒体控制区群体遗传学分析-毕业论文

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1、毕业设计(论文)(20XX届本科)题目:凡纳滨对虾线粒体控制区群体遗传学分析学院:水产与生命学院专业:生物科学(海洋生物方向)班级:姓名:学号:指导教师:20XX年XX月目录摘要................................................................3ABSTRACT............................................................31绪论............................

2、...................................42材料与方法.........................................................42.1研究样品来源及总DNA的提取.........................................42.2mtDNA控制区基因序列的扩增及测序..................................42.3线粒体控制区序列的整理与分析......................

3、...............53结果...............................................................53.1凡纳滨对虾线粒体DNA测序结果.......................................53.2凡纳滨对虾单倍型及单倍型多样性....................................53.3凡纳滨对虾群体间的遗传分化与遗传距离..............................73.4基于m

4、tDNA控制区序列的凡纳滨对虾分子系统树........................94讨论..............................................................104.1凡纳滨对虾种群遗传多样性.........................................104.2凡纳滨对虾的遗传距离和遗传分化...................................104.3线粒体DNA标记鉴别不同凡纳滨对虾养殖群体的可行性.

5、...............10.5.结论..............................................................11参考文献............................................................11凡纳滨对虾的线粒体控制区群体遗传学分析摘要:本研究通过对4个凡纳滨对虾群体即G1、G2、S1、S2的线粒体DNA(mtDNA)控制区部分基因序列的测定,系统的分析了其遗传多样性,对比他们之间系统进化关系。

6、在4个凡纳滨对虾群体共40个样本的线粒体控制区序列中共检测到17种单倍型,其中群体G1和G2单倍型数量最多,分别为8个和6个。S2群体单倍型数最少,仅有1个,S1和S2群体的单倍型个数均为1个。4个群体单倍型多样性(H1)在0.416±0.090~0.973±0.022,其中遗传多样性最高的为G1群体。AMOVE分析结果显示,来自群体间的遗传差异(57.03%)略高于群体内的变异(42.97%)。各群体的遗传分化Fst值均为正值,其中GD组与其他群体之间差异最大。用MEGA5.0基于遗传距离构建系统进化

7、树,结果表明5个凡纳滨对虾群体中,S1和S2遗传距离最近(D=0.017),聚为一支,G2群体聚为一支,G1群体单独聚为一支,4个凡纳滨对虾群体中,4个群体共享单倍型H1,此外,S1和S2共享单倍型H2,G1和G2共享单倍型H11,可能是由于其在选育过程中亲本的遗传背景存在交叉,而G2群体与其他群体遗传距离较远,可能与选择群体样本的地理位置差异相关。关键词:凡纳滨对虾;线粒体DNA控制区基因序列;遗传多样性;单倍型GeneticanalysisforMitochondrialcontrolregiong

8、roupsofVannameiAbstract:ThesurveyhavecomparedandanalyzedtherelationshipbetweenthegeneticdiversityandsystematicrevolutionbytastinghegenesequenceofcontrolregionsectionofmtDNAofG1,G2,S1,S2(4groupofLitopenaeusVannamei).17kinds

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