融合pcr方法构建马尔尼菲青霉菌lig4基因敲除载体

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时间:2018-10-30

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1、融合PCR方法构建马尔尼菲青霉菌LIG4基因敲除载体王琳蓝秀万(通讯作者)(广丙医科大学广丙南宁530021)【摘要】目的构建马尔尼菲青霉菌(Penicilliummarneffei,PM)的UG4基因敲除载体,为敲除UG4基和后期构建PM高效打靶系统提供基础。方法通过PCR扩增UG4基因两翼基因片段及筛选标记基因pyrG基因片段,再用融合PCR方法扩增构建PMLIG4基因敲除载体,并酶切验证。结果用融合PCR成功构建了以pryG为筛选标记基因的PMLIG4基因敵除载体。结论马尔尼菲青霉菌UG4基因敲除载体构建成功,为进一步同源从组敲除PM的LI

2、G4基因构建高效打靶系统提供基础。【关键词】马尔尼菲青霉菌融合PCRUG4基因【中图分类号】R39【文献标识码】A【文章编号】2095-1752(2013)11-0099-02由马尔尼菲青■霉菌(Penicilliummarneffei,PM)是唯一温度依赖双相真菌青霉菌,引起人类系统性真菌感染性疾病,主要感染免疫缺陷患者,尤其是HIV感染者,易误诊,死亡率高[1],近年来其致病分子机制成为研究热点。利用同源从组方法敲除马尔尼菲青霉菌DNA修复关键基因UG4基因,可大大降低其非同源末端连接,从而提高同源重组效率[2],构建一个马尔尼菲青霉菌基因高

3、效打靶系统,为其基因功能研究提供有效的遗传操作工只。1材料与方法1.1材料1.1.1菌株及质粒:马尔尼菲青霉菌尿嘧啶营养缺陷菌株SPM4(实验室保存),大肠杆菌DH5α感受态细胞(TaKaRa公同),质粒pGEM-Teasy(Promega公司),含有pyrG基因质粒pLAX-223(实验室保存)。1.1.2主要仪器:SIGMA台式高速冷冻离心机(仪器型号:3K-15,生产厂家:德国SIGMA),BIOMETRAPCR仪(仪器型号:Tpersonal,生产厂家:德国BIOMETRA),英国UVI凝胶成像分析系统(型号规格:7600Z,

4、生产厂家:日本奥林巴斯公司)。1.1.3主要试剂:Pfu酶(Takara),dNTP(Takara),Biospin胶回收试剂盒(BioFlux公司),MaxiPCRclean-upkit(天根天根生化科技有限公司),引物合成(上海生工生物工程有限公司)。1.2方法构建策略:设计引物,序列如下:LIG4-1F/LIG4-1R(5’-ACGGATGAGATCGTCGGGAC-3’/5’-GGACTTTGAGTGTGAGTGGAAATGTGTAACGGCAAAGGAGACTAGTCCAGGCAGCTATC-3/5&

5、rsquo;-CCGCAAGACGCTCACGCTTG-3’),LIG4-2F/LIG4-2R:(5’-TTGCCGTTACACATTTCCACTCAC-3’/5’-CGCAGACAATGCTCTCTATCC-3’),pyrG-F/pyrG-R(5’-TTGCCGTTACACATTTCCACTCAC-3’/5’—CGCAGACAATGCTCTCTATCC-3’)o扩增质粒pLAX-223的pyrG基因和菌株SPM4中UG4同源基因左右两翼基

6、因UG4-1和LIG4-2,用融合PCR的方法合成(LIG4-1)-pyrG-(LIG4-2)敲除载体基因片段,转化进入大肠杆菌,蓝白斑筛选,电泳鉴定,酶切检验。1.2.1DNA分子操作SPM4菌总DNA提取、纯化,质粒pLAX-223DNA提取、转化方法菌参照文献[3】。1.2.2融合PCR融合PCR原理及过程如图1。第一轮:扩增UG4基因两翼基因LIG4-l,LIG4-2:LIG4-1F/LIG4-1R:,UG4-2F/LIG4-2R引物各lμ,SM4总DNAlμl为模板lμl,Pfu酶0.5μl,PCR程序:95°C

7、×5min,(94°C×30s,55°C×30s,72°C×6min)×30个循环,72°C×10min。第二轮:扩增pyrG基因:pyrG-F/pyrG-R引物各lμ,质粒pLAX-223为模板lμl,Pfu酶0.5μl,PCR程序:95°C×5min,(94°C×30s,58°C×30s,72°C×5min)×30个循环,72°C×10min,4°Cstore。两次PCR产物用0.8

8、%琼脂糖凝胶电泳,用高载量PCR纯化试剂盒冋收基因。第三轮:扩增融合基因(UG4-1)—pyrG—(UG4-2):分别用两次纯化后UG4

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