基因测序问题总结

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1、实验中出现的问题总结1.Panel不能导入markerrepeatmarkerrepeatAmlogenin6D16S5394vWA4FGA4D21S114D3S13584D18S514TH014PentaE5D8S11794D5S8184TPOX4D13S3174CSF1P04D7S8204PentaD5弹出的对话框显示为:"Invalidmarkerrepeatinline#5formarkerAmlogeninvalidmarkerrepeatare2，3，4&9"2.Matrix不通过的原因（1）Insufficientnumberofdyespectradetected

2、!（2）Lowsignal/noise：Checkforfailedinjection.（3）Baddyeorderdetected.（4）Saturateddatadetected.（5）q=0.92860islessthanminQthreshold(0.95000)（6）选择了不适合Dyeset的Module（1）Insufficientnumberofdyespectradetected!（3）Baddyeorderdetected.（4）Saturateddatadetected.（5）q=0.92860islessthanminQthreshold（6）选择了不适合D

3、yeset的Module3.染料堆积(Amlogenin、vWA、D13S317、TH01位点）4.不同颜色峰峰高均衡性不好28个循环，chelex提取，滤纸上的血斑和唾液斑5.TPOX位点前的非特异性扩增峰6.扩增中产生的问题（1）加A不完全，可能和模板量过高有关或体系中含有反应抑制物等(2)位点丢失：模板量过低或模板已降解。(3)小片段位点优势扩增而大片段位点扩增效率低(4)峰值过饱和(5)Pull-up峰：(6)ladder污染?扩增产生？7.电泳中产生的问题（1）OL现象原因：——多个run的Ladder之间相互影响，有聚集偏移倾向，Ladder峰偏离了Bin，样品峰也偏

4、离了Bin。这种情况之下将样品和相对应的Ladder重新建立project，重新分析，如果能对应就不必重新扩增。(2)变性不完全：甲酰胺质量不好或没有进行变性（3）两个等位基因峰合在一起——电泳分辨率下降（缓冲液PH值改变或胶时间过长）下图为正常现象(4)电泳时出现的尖锐的小峰1在ladder中，箭头所指杂峰容易影响panal中ABO基因座的位置2Ladder杂峰导致panal中ABO261座位移动3修正后的结果不足：（1）衍生峰太高；（2）Ladder中75bp处杂峰请大家共同讨论