ion torrent基因测序仪

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1、SemiconductorSequencingforLife™IonTorrent离子半导体测序平台为医学与转化医学研究带来新的机遇新一代半导体高通量Ion测序平台介绍Iontorrent平台在医学及临床诊断领域应用1）肿瘤2）妇婴生育保健领域3）HLA分型4）病院微生物领域IonTorrent部分用户名单内容23新一代半导体高通量Ion测序平台介绍IonSemiconductorSequencing:Scalability,Simplicity,Speed,BenchtopSequencingforAll

2、PGM™forGenes.Proton™forGenomes.SequencingforAll.2011Q12012Q3IonPGMTMSequencerIonProtonTMSequencerIon测序技术平台——FirstPostLight™sequencingtechnologyFounded2007byJonathanRothbergPioneerednextgenesequencingFounded454,CuraGen,RaindancePartofLifeTechnologieswithoff

3、icesinConnecticut,Massachusetts,andCaliforniaGlobalmanufacturingsitesAnnouncein2010AGBTLaunchedDecember2010快速完成检测PGMChips:314Chip:1.2Mwells316Chip:6.1Mwells318Chip:11MwellsRothbergJ.M.etalNaturedoi:10.1038/nature10242SensorPlateSiliconSubstrateDrainSourceB

4、ulkdNTP∆pH∆Q∆VSensingLayerH+64种dNTP依次流过Ion芯片DNA聚合反应产生的氢离子的直接检测每个碱基的检测只需要几秒扩展性高CMOS(互补金属氧化物半导体)技术40年的摩尔定律简单天然dNTP无激光光源非光学检测无拍照系统非荧光检测非酶级联放大检测速度快快速完成测序反应7芯片就是测序仪IonPI™ChipIonPI™Chip用来完成外显子组和转录组测序IonPII™Chip完成全基因组测序165MwellsUpto10Gb60-80MFilteredReads1-2Exom

5、es1-4Transcriptomes660MwellsUpto20Xhumangenome240-320MFilteredReads4-8Exomes4-16TranscriptomesIonPII™ChipThecontentprovidedhereinmayrelatetoproductsthathavenotbeenofficiallyreleasedandissubjecttochangewithoutnoticeSmallGenomeTranscriptome100M1G10GSequence

6、OutputperRun100GExomeSmalltoLargeGenePanels10MUnprecedentedScalability10,000-FoldFromIon314™toIonPIII™ChipIon316™Ion314Ion318™IonPII™HumanGenomeIonPI™IonPIII™From1.2MillionSensors…………………to1.2BillionSensorsThecontentprovidedhereinmayrelatetoproductsthathave

7、notbeenofficiallyreleasedandissubjecttochangewithoutnotice10Ion技术平台在各研究领域应用病源微生物领域：细菌、病毒等denovo全基因组测序菌群宏基因组测序（16SrRNA）耐药菌株筛选妇婴生育保健领域：新生儿遗传病筛查无创产前诊断胚胎移植前染色体/遗传病检测（试管婴儿）线粒体DNA突变筛查肿瘤领域：早期诊断、个性化治疗、预后监督Ion测序平台应用于临床诊断及医学研究HLA分型：器官移植、个性化药物治疗1.IonAmpliseq技术应用于肿瘤诊断

8、及个性化治疗IonAmpliseq技术多重PCR靶向捕获技术，在一个反应管内可同时进行几千重甚至上万重PCR起始DNA量最低仅需10ng，适合FFPE标本及其他微量标本适合降解样本，采用150bp引物扩增设计Readsontarget效率高（96%以上），覆盖均一性好+ConstructLibraryPrepareTemplateRunSequenceAnalyzeDataIonAmpliseqPanels---